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B612

铁虫 (小有名气)

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[求助] 过渡态

用qst2计算过渡态时反应物有两个，输入文件中反应物的坐标不知道应该怎么处理，这种情况是不是需要插入虚原子？我计算的是NH3+H2O=NH3.H2O的过渡态，以前没接触过过渡态，输入文件这里都耗费了好久了，请各位大侠出手相助，将不胜感激。

[ Last edited by B612 on 2012-12-5 at 11:02 ]

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1楼 2012-12-05 11:00:55

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B612

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引用回帖:

5楼: Originally posted by ryxiao at 2012-12-06 17:48:07
你的反应物是一个complex吧,NH3和H2O离得很近，在gjf里面看起来不就是一个物质了
有没有过渡态难说，即便有，找不找得也难说，

不好意思，刚刚我把输入文件给错了，是这个
#p rb3lyp/6-311G** opt=qst2 test

Gaussian:
reactant NH3 +H2O -> NH3.H2O ts with constrained transition vector

0 1
N                0.00000000 0.00000000 0.00000000
H                0.00000000 0.00000000 1.01361086
H                0.96715224 0.00000000 -0.30219687
H                -0.41402999 -0.87391355 -0.30225104
O                -1.34873353 2.54903428 -0.56048674
H                -0.92828188 1.67232201 -0.46963449
H                -1.73459256 2.56222882 -1.43999539

product NH3 +H2O -> NH3.H2O ts with constrained transition vector

0 1
N                0.00000000 0.00000000 10.36481339
H                0.95633752 0.31851332 10.46700859
H                0.03439987 -0.93229441 9.96974468
H                -0.44487470 0.59989710 9.68020669
O                0.00000000 0.00000000 0.00000000
H                0.96187011 0.00000000 -0.00195102
H                -0.25184892 0.00252732 -0.92832241