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B612

铁虫 (小有名气)

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[求助] 过渡态

用qst2计算过渡态时反应物有两个，输入文件中反应物的坐标不知道应该怎么处理，这种情况是不是需要插入虚原子？我计算的是NH3+H2O=NH3.H2O的过渡态，以前没接触过过渡态，输入文件这里都耗费了好久了，请各位大侠出手相助，将不胜感激。

[ Last edited by B612 on 2012-12-5 at 11:02 ]

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1楼 2012-12-05 11:00:55

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B612

铁虫 (小有名气)

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引用回帖:

5楼: Originally posted by ryxiao at 2012-12-06 17:48:07
你的反应物是一个complex吧,NH3和H2O离得很近，在gjf里面看起来不就是一个物质了
有没有过渡态难说，即便有，找不找得也难说，

嘿嘿..谢谢，我发现是202错误，结构不合理，我一直认为是离得太远了，这是我的输入文件，麻烦你给我看看吧
#p rb3lyp/6-311G**opt=qst2 test

Gaussian:
reactant NH3 +H2O -> NH3.H2O ts with constrained transition vector

0 1
N
H                1 1.01361086
H                1 1.01326522 2  107.35196282
H                1 1.01316406 3  107.52252921 2 -115.23991561 0
O                1 2.93782288 4  120.25735978 2 -114.44004352 0
H                5 0.97655421 1 6.08698782 4  -40.51648096 0
H                5 0.96051900 1  111.77963430 4  -40.22358808 0

product NH3 +H2O -> NH3.H2O ts with constrained transition vector

0 1
O
N                1 10.36481339
H                1 0.96187209 2 90.11621611
H                1 0.96188189 2  164.82057944 3 -179.42505302 0
H                2 1.01315154 1 95.78919154 3 18.42061254 0
H                2 1.01313153 1 67.04873005 3  -87.88685457 0
H                2 1.01315170 1 47.48992514 3  126.56007817 0