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seamas_gao2新虫 (小有名气)
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请问只有一个个体的某一个碱基发生变化，算SNP吗？
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| 我做了几十个个体的序列比对，发现某个碱基上只有一个个体发生了变化，请问这个 算SNP吗，谢谢！ |
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 【分子生物】EPI帖 |
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2楼2012-12-03 15:06:30
gyesang
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从你自己的数据来看不能判断是否是SNP SNP，single nucleotide polymorphism，单核苷酸多态性，是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA 序列多态性,在群体中的发生频率不小于1 %。SNP是对一个群体而言的概念 你现在做了几十个个体的序列比对，发现某个碱基上只有一个个体发生了变化，这个碱基变化位点是否是SNP，你可以先查阅NCBI的SNP二级数据库是否有记录，如果有记录那么这个位点可能是SNP位点，如果没有记录，那么你现有的样本量还是不能得出这个位点是SNP位点的结论。 |
3楼2012-12-03 16:56:31
