24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 845  |  回复: 2
本帖产生 1 个 MolEPI ,点击这里进行查看

seamas_gao2

新虫 (小有名气)

[求助] 请问只有一个个体的某一个碱基发生变化,算SNP吗?

我做了几十个个体的序列比对,发现某个碱基上只有一个个体发生了变化,请问这个 算SNP吗,谢谢!
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
amisking: 回帖置顶 2012-12-03 21:07:54
amisking: 金币+3, 鼓励积极发帖帮助解答问题。 2012-12-03 21:08:04
小丹木木: 金币+2, MolEPI+1, 鼓励积极应助 2012-12-04 21:09:03
seamas_gao2: 金币+8, ★★★★★最佳答案, 十分感谢! 2012-12-07 08:28:45
从你自己的数据来看不能判断是否是SNP
SNP,single nucleotide polymorphism,单核苷酸多态性,是指基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA 序列多态性,在群体中的发生频率不小于1 %。SNP是对一个群体而言的概念

你现在做了几十个个体的序列比对,发现某个碱基上只有一个个体发生了变化,这个碱基变化位点是否是SNP,你可以先查阅NCBI的SNP二级数据库是否有记录,如果有记录那么这个位点可能是SNP位点,如果没有记录,那么你现有的样本量还是不能得出这个位点是SNP位点的结论。
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2012-12-03 16:56:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

448935271

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
seamas_gao2: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-12-07 08:28:51
你可以在NCBI上查找一下该位点是否属于SNP
万物皆有毒,只要剂量足
2楼2012-12-03 15:06:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 seamas_gao2 的主题更新
信息提示
请填处理意见