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VASP5.3.2大内存崩溃的解决方案
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当原子数很多时，同样体系，vasp5.2.2或者vasp4.6.38计算不出问题，vasp5.3.2计算会遇到大内存导致节点down或段错误。 原因是vasp5.3.2在第一个离子步之后，当ALGO/=ALL的情况下，会自作主张的重新生成一下WAVE，而在vasp5.2.2里是没有的。 解决办法： （仅针对vasp5.3.2，其他版本没有测试） main.F 2636行开始 把以下内容中涉及 IF (.NOT.INFO%LONESW) THEN **** ENDIF 的 注释掉! IF (NSTEP==1) THEN ! IF (.NOT.INFO%LONESW) THEN ! CALL ALLOCW(WDES,W_F,WTMP,WTMP) ! CALL ALLOCW(WDES,W_G,WTMP,WTMP) ! DEALLOCATE(CHAM, CHF) ! ALLOCATE(CHAM(WDES%NB_TOT,WDES%NB_TOT,WDES%NKPTS,WDES%ISPIN), & ! CHF (WDES%NB_TOT,WDES%NB_TOT,WDES%NKPTS,WDES%ISPIN)) !! ! setup for scf subspace rotation !! INFO%LONESW=.TRUE. !! CALL SETUP_SUBROT_SCF(INFO,WDES,LATT_CUR,GRID,GRIDC,GRID_SOFT,SOFT_TO_C,IO%IU0,IO%IU5,IO%IU6) !! INFO%LONESW=.FALSE. ! ENDIF CALL PEAD_ELMIN( & HAMILTONIAN,KINEDEN, & P,WDES,NONLR_S,NONL_S,W,W_F,W_G,LATT_CUR,LATT_INI, & T_INFO,DYN,INFO,IO,MIX,KPOINTS,SYMM,GRID,GRID_SOFT, & GRIDC,GRIDB,GRIDUS,C_TO_US,B_TO_C,SOFT_TO_C,E, & CHTOT,CHTOTL,DENCOR,CVTOT,CSTRF, & CDIJ,CQIJ,CRHODE,N_MIX_PAW,RHOLM,RHOLM_LAST, & CHDEN,SV,DOS,DOSI,CHF,CHAM,ECONV, & NSTEP,LMDIM,IRDMAX,NEDOS, & TOTEN,EFERMI,LDIMP,LMDIMP) ! IF (.NOT.INFO%LONESW) THEN ! CALL DEALLOCW(W_F) ! CALL DEALLOCW(W_G) ! DEALLOCATE(CHAM, CHF) ! ALLOCATE(CHAM(1,1,1,1),CHF (1,1,1,1)) ! ENDIF ENDIF PEAD_ELMIN 说明： ! This subroutine is called from main.F and takes care of one or all ! of the following: ! ! ) calculate the macroscopic dipole moment in the cell ! ) calculate the SCF and/or non-SCF response to an electric ! field specified through EFIELD_PEAD in the INCAR file ! ) calculate the dielectric tensor excluding and/or ! including local field effects 以上注释后，仅会影响如上量的计算，其它量不影响。 补充说明： vasp5.3.2这个问题，用以往网上说的 在FFLAGS 选项的赋值中增加 -heap-arrays 64 运行的时候加 ulimit -s unlimited 换用pgi+acml 都是无法解决的。 [ Last edited by y1ding on 2012-11-30 at 21:17 ] |
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7楼2012-12-03 21:28:06
8楼2013-05-22 17:17:30
★★★ 三星级,支持鼓励
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我尝试了vasp.5.2.11 这样的方法行不通 Bad Luck。 我的帖子 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=5873476 “VASP 计算的一个棘手的难题 ” |
9楼2013-05-22 22:19:29
10楼2013-05-23 09:52:02