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汕头大学海洋科学接受调剂
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[资源] VASP5.3.2大内存崩溃的解决方案

当原子数很多时,同样体系,vasp5.2.2或者vasp4.6.38计算不出问题,vasp5.3.2计算会遇到大内存导致节点down或段错误。
原因是vasp5.3.2在第一个离子步之后,当ALGO/=ALL的情况下,会自作主张的重新生成一下WAVE,而在vasp5.2.2里是没有的。
解决办法:
(仅针对vasp5.3.2,其他版本没有测试)   
    main.F 2636行开始 把以下内容中涉及 IF (.NOT.INFO%LONESW) THEN **** ENDIF 的 注释掉!
      IF (NSTEP==1) THEN
!         IF (.NOT.INFO%LONESW) THEN
!            CALL ALLOCW(WDES,W_F,WTMP,WTMP)
!            CALL ALLOCW(WDES,W_G,WTMP,WTMP)
!            DEALLOCATE(CHAM, CHF)
!            ALLOCATE(CHAM(WDES%NB_TOT,WDES%NB_TOT,WDES%NKPTS,WDES%ISPIN), &
!              CHF (WDES%NB_TOT,WDES%NB_TOT,WDES%NKPTS,WDES%ISPIN))
!!           ! setup for scf subspace rotation
!!           INFO%LONESW=.TRUE.
!!           CALL SETUP_SUBROT_SCF(INFO,WDES,LATT_CUR,GRID,GRIDC,GRID_SOFT,SOFT_TO_C,IO%IU0,IO%IU5,IO%IU6)
!!           INFO%LONESW=.FALSE.
!         ENDIF
         CALL PEAD_ELMIN( &
          HAMILTONIAN,KINEDEN, &
          P,WDES,NONLR_S,NONL_S,W,W_F,W_G,LATT_CUR,LATT_INI, &
          T_INFO,DYN,INFO,IO,MIX,KPOINTS,SYMM,GRID,GRID_SOFT, &
          GRIDC,GRIDB,GRIDUS,C_TO_US,B_TO_C,SOFT_TO_C,E, &
          CHTOT,CHTOTL,DENCOR,CVTOT,CSTRF, &
          CDIJ,CQIJ,CRHODE,N_MIX_PAW,RHOLM,RHOLM_LAST, &
          CHDEN,SV,DOS,DOSI,CHF,CHAM,ECONV, &
          NSTEP,LMDIM,IRDMAX,NEDOS, &
          TOTEN,EFERMI,LDIMP,LMDIMP)
!         IF (.NOT.INFO%LONESW) THEN
!            CALL DEALLOCW(W_F)
!            CALL DEALLOCW(W_G)
!            DEALLOCATE(CHAM, CHF)
!            ALLOCATE(CHAM(1,1,1,1),CHF (1,1,1,1))
!         ENDIF        
      ENDIF

PEAD_ELMIN 说明:
! This subroutine is called from main.F and takes care of one or all
! of the following:
!
!  ) calculate the macroscopic dipole moment in the cell
!  ) calculate the SCF and/or non-SCF response to an electric
!    field specified through EFIELD_PEAD in the INCAR file
!  ) calculate the dielectric tensor excluding and/or
!    including local field effects

以上注释后,仅会影响如上量的计算,其它量不影响。

补充说明:
vasp5.3.2这个问题,用以往网上说的
在FFLAGS 选项的赋值中增加  -heap-arrays  64
运行的时候加 ulimit -s unlimited
换用pgi+acml
都是无法解决的。

[ Last edited by y1ding on 2012-11-30 at 21:17 ]
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引用回帖:
5楼: Originally posted by y1ding at 2012-12-02 22:22:23
openmpi ifort9.1 gotoblas2 编译...

我昨天试了几次, gotoblas2 编译不过去,过去到vasp这步就有问题,请教你的 gotoblas2的makefile.rule。谢谢
6楼2012-12-03 08:36:18
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查看全部 10 个回答

emilyoyang

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

SF ,   not bad~~~
you can give Georg Kresse an email on this problem and your solution~~~
2楼2012-12-01 09:19:17
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花无刺

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

高手啊

没有vasp5.3.2

纯支持一下
3楼2012-12-02 11:26:48
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★★★★★ 五星级,优秀推荐

请问楼主编译5.3的时候用的是gotoblas2吗,我的gotoblas2总是编译不过去
4楼2012-12-02 11:52:27
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