24小时热门版块排行榜    

查看: 566  |  回复: 4

cj陈娇

铜虫 (小有名气)

[求助] 过渡态

在用高斯找过渡态时,这种前驱复合物结构是如何得到的。希望这方面的高手给点指导,万分感谢!
回复此楼
静静的就好
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xyz7819227

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
图呢?一般用高斯找过渡态的话是要先运用化学知识来判断过渡态的可能结构,然后再根据反应物结构来优化、寻找过渡态
海纳百川,有容乃大
2楼2012-11-28 20:19:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cj陈娇

铜虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by xyz7819227 at 2012-11-28 20:19:25
图呢?一般用高斯找过渡态的话是要先运用化学知识来判断过渡态的可能结构,然后再根据反应物结构来优化、寻找过渡态

我的过渡态找到了,根据文献他有氢键复合物存在,但是我不知道氢键复合物的结构怎么获得。希望你能给点意见啊,万分感谢!
ts-3.out(408.89KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GBDHQPLLRYZF?p=130497
irc.out(935.17KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GPPYDDVFDMHV?p=130497
静静的就好
3楼2012-11-29 09:04:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lxhlxh052c

木虫 (著名写手)

小木虫之无虫

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
引用回帖:
3楼: Originally posted by cj陈娇 at 2012-11-29 09:04:26
我的过渡态找到了,根据文献他有氢键复合物存在,但是我不知道氢键复合物的结构怎么获得。希望你能给点意见啊,万分感谢!
ts-3.out(408.89KB)
http://kuai.xunlei.com/d/GBDHQPLLRYZF?p=130497
irc.out(935.17 ...

楼主我看你的输出文件里面又是羟基又是F的,体系中的氢键作用应该挺明显的。就那个F代的分子自身来说就能形成分子内的氢键(可能是五元或者六元环的结构)。当然分子间的氢键也能形成的,结构应该多种多样~
你用的是羟基自由基与这个分子作用吧,那么羟基自由基上的H也是有可能和F作用形成氢键的。如果你在羟基自由基与羟基作用那找到过渡态,也跑了IRC那看看的IRC末态优化出来是啥样的吧,关键看看主反应键的键长是在氢键的范围还是在经典的化学成键范围。我觉得这个反应就是形成氢键的反应。难道还有自由基的传递吗?
我说的这些都是从基本的有机化学角度考虑的,希望对你有点帮助。
这就是我想要的
4楼2012-11-29 09:53:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xy00083789

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

1. 楼主,我把你的out文件下载下来之后,简单的得到了fchk文件,通过弱作用分析( Journal of the American Chemical Society 132(18): 6498-6506.),三维ELF函数分析,发现体系中,根本就不存在氢键,我的邮箱是zhongyue.yang@yahoo.cn 你给我发个邮件,我把那些数据给你,你就知道啦。
2. 另外,我提到的那些分析方法,是从sobereva老师的帖子学到的,建议你关注一下这个博客http://hi.baidu.com/new/sobereva?page=12
3.Mutiwfn软件,建议你关注
欢迎交流zhongyue.yang@yahoo.cn
5楼2012-12-01 20:21:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 cj陈娇 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考博] 售SCI文章,我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 5/250 2026-08-15 04:45 by 4wMiSEwB6436
[考研] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 7lpolszZVXgi 2026-08-14 6/300 2026-08-15 04:21 by 4wMiSEwB6436
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 HFw0lei2R37i 2026-08-14 4/200 2026-08-15 04:17 by 4wMiSEwB6436
[找工作] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 k0dTPqJtl0jt 2026-08-14 4/200 2026-08-15 02:21 by 4wMiSEwB6436
[基金申请] 小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊 +11 Tide man 2026-08-10 12/600 2026-08-15 02:12 by home3163
[基金申请] 各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。 +7 Tide man 2026-08-14 8/400 2026-08-15 01:11 by arzu_hma
[基金申请] 咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否 +7 启萌科技 2026-08-12 22/1100 2026-08-14 23:45 by Noways
[基金申请] 欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律 +23 医学老男孩 2026-08-13 49/2450 2026-08-14 20:02 by zhaifei
[基金申请] 哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜? +5 Ldrop2023 2026-08-13 5/250 2026-08-14 18:48 by ssxclkj
[基金申请] 应该是93bebmhtak前后十一个字符比较关键 +23 Lanmanbaby 2026-08-09 37/1850 2026-08-14 13:40 by Equinoxhua
[硕博家园] 请教兼职经验 +3 是阿文鸭 2026-08-09 3/150 2026-08-14 12:07 by HER12025
[基金申请] FileCode能看出啥? +10 要乐观耀哥 2026-08-10 32/1600 2026-08-14 09:37 by 要乐观耀哥
[基金申请] 关于Filecode分析方法 +9 majunge000 2026-08-10 12/600 2026-08-13 23:20 by iwuli
[基金申请] 静等基金结果 +8 gjjjzhong 2026-08-10 21/1050 2026-08-13 17:56 by 且听虎啸
[基金申请] 重要来源:本周末出结果 +10 瞬息宇宙 2026-08-12 10/500 2026-08-13 15:46 by likettle
[基金申请] Filecode 又变了,巨变 +3 WH3796 2026-08-12 4/200 2026-08-13 14:13 by 小木虫6752397
[基金申请] 分享一下我之前已中青C的计划书的filecode +4 布布和一二 2026-08-11 5/250 2026-08-13 12:56 by cratir
[基金申请] 什么时候出结果,有咨询渠道??? +3 Tide man 2026-08-11 3/150 2026-08-11 17:54 by kudofaye
[基金申请] 确定了,国自然21号放榜 +6 布布和一二 2026-08-10 7/350 2026-08-10 19:15 by 2000zf36392
[基金申请] fileCode有新解读? +10 Tide man 2026-08-08 18/900 2026-08-09 12:55 by 仁砚薪传
信息提示
请填处理意见