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本地数据库无法用makeblastdb格式化
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从hmpdacc下载了一个蛋白数据库 fasta格式的 但里面有重复序列 运行makeblastdb时会报错 文件比较大 在全部读进内存之前就会死机 手动改不了 不知有没有给本地数据库去冗余的perl模块或程序包 望高手指点 |
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wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
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【答案】应助回帖
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ldy2140: 金币+5, ★有帮助, Thanks a lot. This problem has been solved by rebuilding the database from other source. 2013-06-25 15:07:17
ldy2140: 金币+5, ★有帮助, Thanks a lot. This problem has been solved by rebuilding the database from other source. 2013-06-25 15:07:17
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a quick hash in perl will do the job. When you open a filehandle in Perl, little memory is used. then while( |
2楼2013-02-06 19:26:24