| 查看: 2047 | 回复: 1 | ||
[求助]
本地数据库无法用makeblastdb格式化
|
|
从hmpdacc下载了一个蛋白数据库 fasta格式的 但里面有重复序列 运行makeblastdb时会报错 文件比较大 在全部读进内存之前就会死机 手动改不了 不知有没有给本地数据库去冗余的perl模块或程序包 望高手指点 |
» 猜你喜欢
有时候,自然基金真的不能太认真 (我的申报经验)
已经有10人回复
filecode
已经有12人回复
filecode=后面第一个是大写字母
已经有4人回复
时间戳又变了8-15
已经有20人回复
小木虫上这么多卖论文的,真有人买论文么?感觉没必要啊
已经有13人回复
欢迎发来filecode的Mz6后的代码验证其规律
已经有58人回复
哪位老哥知道今年的国自然具体哪一天放榜?
已经有7人回复
关于Filecode分析方法
已经有13人回复
各位道友,我要去昆明玩几天,回来见。
已经有8人回复
咱们一起用铁证分析2026国家社科基金中标与否
已经有22人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

wizardfan
至尊木虫 (著名写手)
- 应助: 599 (博士)
- 贵宾: 1.818
- 金币: 24644.2
- 散金: 197
- 红花: 48
- 沙发: 2
- 帖子: 2254
- 在线: 400.7小时
- 虫号: 1879241
- 注册: 2012-07-05
- 性别: GG
- 专业: 生物信息学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★
ldy2140: 金币+5, ★有帮助, Thanks a lot. This problem has been solved by rebuilding the database from other source. 2013-06-25 15:07:17
ldy2140: 金币+5, ★有帮助, Thanks a lot. This problem has been solved by rebuilding the database from other source. 2013-06-25 15:07:17
|
a quick hash in perl will do the job. When you open a filehandle in Perl, little memory is used. then while( |
2楼2013-02-06 19:26:24










回复此楼