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xingyanfei金虫 (正式写手)
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vmd如何构建双壁碳纳米管
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vmd如何构建双壁碳纳米管， 我用nanotube.tcl，生成两个swnt然后将他两个合并，但是不对呀，总是两层连在一起呀，这个怎么办的呀！？  |
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2楼2012-11-27 21:16:34
xingyanfei
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3楼2012-11-27 21:28:04
xingyanfei
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4楼2012-11-27 21:37:07
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
zh1987hs: 金币+4, 谢谢 2012-11-28 10:39:56
zh1987hs: 金币+4, 谢谢 2012-11-28 10:39:56
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很简单，很容易 你导入到VMD中的是pdb文件吧？ 你在MS中建立的是pdb文件能正常显示，而到VMD中就连在一起，是因为VMD中的PDB文件显示的时候，内侧纳米管到外侧纳米管的距离小于VMD默认原子之间成键的距离。你试试建立一个外管直径比内管直径大多一些的模拟，就不会这样了。 要想把你 hezhe.jpg 正常显示成 fenkai.jpg那样，就需要你生成PSF文件，然后在VMD中同时导入PSF 和 PDB 文件。 具体怎么导入 PSF 和 PDB 文件，以及怎么生成psf文件，去看看VMD和NAMD 手册，讲的很清楚。论坛里也有很多资料。 |
5楼2012-11-27 22:15:35
xingyanfei
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6楼2012-11-28 09:14:04
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