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5266720

铜虫 (小有名气)

[求助] Illumina solexa转录组测序 已有1人参与

我正在做转录组方面的实验,用Illumina solexa 来分析两植物样本受到虫害影响后的基因差别。在后续分析中,我要找差异基因,可以直接用差异转录本代替吗,有做这方面的老师吗,是怎么处理的呢?
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gaoyang636

木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

来分析两植物样本的基因差别。
能不能请问一下lz,你本来觉得做一个刺激之后所能得到的基因差别是啥呢 一般而言我们关注地,不就是表达量的变化么?
我觉得RNA-Seq能做到的:其一同时也是最常见的就是量的差别,在reference完善的情况下,表达量的差异都是尽量用转录本的表达量。
其二可以看新转录本,发现新的剪接形式。
8楼2013-01-22 09:03:49
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5266720

铜虫 (小有名气)

怎么没有人回呢!? 急需指导啊!
2楼2012-11-28 08:56:07
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5266720

铜虫 (小有名气)

求高手指导啊!!!!
3楼2012-11-29 08:41:44
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drxiao2005

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
只鉴定差异表达基因的话,林论上差异转录本就是了。但需要用其他手段进行验证,如RT-PCR.
4楼2012-11-29 09:26:25
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