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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 蛋白质质谱解析，发现少了N-末端氨基酸
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lannyzou

新虫 (初入文坛)

[求助] 蛋白质质谱解析，发现少了N-末端氨基酸

蛋白质做ESI-MS，发现分子量刚好少了N-末端的MET残基，有没有知道怎么回事？

然后做trypsin digestion，找不到N-末端的那段sequence，哪位知道哪里出问题了？

谢谢。
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1楼 2012-11-23 16:18:49
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weigh1111

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
是不是被切掉了哦……比如信号肽啊什么的~
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2楼2012-11-23 16:59:00
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酶切专家

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
N端氨基酸降解很正常
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3楼2012-11-23 19:34:47
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
N末端的Met被修饰切除在真核生物中是比较常见的一种蛋白修饰。
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4楼2012-11-24 02:47:07
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lannyzou

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-11-24 02:47:07
N末端的Met被修饰切除在真核生物中是比较常见的一种蛋白修饰。

谢谢。
我不是生物专业的，能不能麻烦你解释一下为什么会有这种现象？这种修饰有什么作用吗？
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5楼2012-11-27 09:30:51
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lannyzou

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cicelyzh at 2012-11-24 02:47:07
N末端的Met被修饰切除在真核生物中是比较常见的一种蛋白修饰。

谢谢。
我不是生物专业的，能不能麻烦你解释一下为什么会出现这种现象？这种修饰有什么作用吗？
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6楼2012-11-27 09:32:37
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悠悠落叶

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 解释的很清楚 2012-11-27 13:56:10
引用回帖:
6楼: Originally posted by lannyzou at 2012-11-27 09:32:37
谢谢。
我不是生物专业的，能不能麻烦你解释一下为什么会出现这种现象？这种修饰有什么作用吗？...

因为Met是合成起始氨基酸，起始密码子编码的就是这个氨基酸，一般的都没什么作用，所以合成完了就被切除掉了啊，很正常
在这里：复制粘贴于（http://zh.wikipedia.org/wiki/%E9%81%97%E4%BC%A0%E5%AF%86%E7%A0%81）蛋白质的转译从初始化密码子（起始密码子）开始，但亦需要适当的初始化序列和起始因子才能使mRNA和核糖体结合。最常见的起始密码子为AUG，其同时编码的氨基酸在细菌为甲酰甲硫氨酸，在真核生物为甲硫氨酸，但在个别情况其它一些密码子也具有起始的功能。
在经典遗传学中，终止密码子各有名称：UAG为琥珀（amber），UGA为蛋白石（opal），UAA为赭石（ochre）。这些名称来源于最初发现到这些终止密码子的基因的名称。终止密码子使核糖体和释放因子结合，使多肽从核糖体分离而结束转译的程式。另外，在哺乳动物的线粒体中，AGA和AGG也充当终止密码子。
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索马鲁肽，利拉鲁肽，德谷胰岛素，InsulinIcodec胰岛素侧链，发酵索玛/利拉直链热卖
7楼2012-11-27 10:28:54
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
6楼: Originally posted by lannyzou at 2012-11-27 09:32:37
谢谢。
我不是生物专业的，能不能麻烦你解释一下为什么会出现这种现象？这种修饰有什么作用吗？...

具体上这种修饰有什么作用我也不知道。也许是单纯把编码Met的密码子作为起始转绿和翻译的信号，而成熟蛋白质可以不需要以Met作为第一个氨基酸吧。
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8楼2012-11-27 11:44:05
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