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看天

木虫 (知名作家)

[求助] DNAMAN通道怎么用?

我要做的是从文献里复制、粘贴一段序列,再复制粘贴一段序列,然后两者比对,怎么做?:
DNAMAN什么通道啊 乱七八糟的,粘贴一段序列,点击下一个通道怎么还是那段序列?

[ Last edited by silicare on 2014-2-18 at 17:20 ]
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戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
看天: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-11-21 14:23:44
引用回帖:
5楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-21 13:21:24
我吧序列 粘贴到 text中,更改后缀名为seq,可以用DNAman打开同时打开时会多出一部分关于序列的前缀,但是如果直接用以text打开,却只有序列,没有其他更多的信息。...

你实在想通过改文件名或者不改文件名也是可以实现的。但是要将序列在txt文件中弄为fasta格式:
fasta序列格式如下:(自己网上去查阅)
>序列的定义信息
GATCTATATATAAT

可以将txt后缀改为.seq或者不改也可以。但是用DNAMAN加载序列是,一定要从 序列-->加载序列-->从文件夹,找到你要加载的文件,txt或者.seq均可
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
7楼2012-11-21 14:06:13
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gyesang

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
看天: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-11-21 13:15:04
看天: 金币+10 2012-11-21 13:21:32
小丹木木: 金币+5, MolEPI+1, 真是细心又热心的虫虫啊 2012-11-21 17:23:22
楼主没有用对DNAMAN
第一步:先打开DNAMAN软件,楼主鼠标先点击左边通道1,软件窗口最下面出出现: channel 1: empty
                        channel: empty
                          ............
这是对界面的基本认识,如果把序列装到channel 1里面,empty就变了,不是empty了
那怎么将序列装到channel1呢?

第二步:楼主是从文献里复制和粘帖的,所以你貌似点了channel1,然后出现空白区域,你粘帖一下,序列进去了。实际上此时的序列并没有进channel1,你可以注意下面的状态。
所以将序列装进channel 1可以这么做,你复制了序列,然后 点File-->New,将序列粘帖进去,然后再File--》save as将序列保存一下,格式选为 .seq格式,自己命个名叫sequence 1保存到一个文件夹里面,同理序列2经过相同操作,保存为sequence 2

第三步:将刚才保存的序列1和2分别装进channel1和channel2里面,先选中channel1, 点sequence-->loading sequence-->from sequence file,找到你刚才保存的序列,序列就装进channel1了,注意下面的状态变化,序列装channel2同理

第四步:channel1和channel2序列比对,sequence--》alignment,出现个对话框,比对即可

希望对楼主有用!
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2012-11-21 13:09:51
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看天

木虫 (知名作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2012-11-21 13:09:51
楼主没有用对DNAMAN
第一步:先打开DNAMAN软件,楼主鼠标先点击左边通道1,软件窗口最下面出出现: channel 1: empty
                        channel: empty
                          ............
这是对界 ...

看来还是不能直接复制粘贴这么省事了!
我用的是汉化版的:我选择一seq序列文件(text更改后缀名)时,怎么出现 “contain a invalid path"?
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
4楼2012-11-21 13:17:13
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看天

木虫 (知名作家)

引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2012-11-21 13:09:51
楼主没有用对DNAMAN
第一步:先打开DNAMAN软件,楼主鼠标先点击左边通道1,软件窗口最下面出出现: channel 1: empty
                        channel: empty
                          ............
这是对界 ...

我吧序列 粘贴到 text中,更改后缀名为seq,可以用DNAman打开同时打开时会多出一部分关于序列的前缀,但是如果直接用以text打开,却只有序列,没有其他更多的信息。
戒嗔怒以养肝气,省言语以养神气,多读书以养质气,顺时令以养元气,不拘节以养大气,观天变以养灵气,莫强求规于运气。
5楼2012-11-21 13:21:24
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