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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » DNAMAN通道怎么用？
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看天

木虫 (知名作家)

[求助] DNAMAN通道怎么用？

我要做的是从文献里复制、粘贴一段序列，再复制粘贴一段序列，然后两者比对，怎么做？：
DNAMAN什么通道啊 乱七八糟的，粘贴一段序列，点击下一个通道怎么还是那段序列？

[ Last edited by silicare on 2014-2-18 at 17:20 ]
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看天

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戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
1楼 2012-11-21 12:35:52
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gyesang

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【答案】应助回帖

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感谢参与，应助指数 +1
看天: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-11-21 13:15:04
看天: 金币+10 2012-11-21 13:21:32
小丹木木: 金币+5, MolEPI+1, 真是细心又热心的虫虫啊 2012-11-21 17:23:22
楼主没有用对DNAMAN
第一步：先打开DNAMAN软件，楼主鼠标先点击左边通道1，软件窗口最下面出出现： channel 1: empty
                        channel: empty
                          ............
这是对界面的基本认识，如果把序列装到channel 1里面，empty就变了，不是empty了
那怎么将序列装到channel1呢？

第二步：楼主是从文献里复制和粘帖的，所以你貌似点了channel1，然后出现空白区域，你粘帖一下，序列进去了。实际上此时的序列并没有进channel1，你可以注意下面的状态。
所以将序列装进channel 1可以这么做，你复制了序列，然后 点File-->New，将序列粘帖进去，然后再File--》save as将序列保存一下，格式选为 .seq格式，自己命个名叫sequence 1保存到一个文件夹里面，同理序列2经过相同操作，保存为sequence 2

第三步：将刚才保存的序列1和2分别装进channel1和channel2里面，先选中channel1, 点sequence-->loading sequence-->from sequence file,找到你刚才保存的序列，序列就装进channel1了，注意下面的状态变化，序列装channel2同理

第四步：channel1和channel2序列比对，sequence--》alignment，出现个对话框，比对即可

希望对楼主有用！
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3楼2012-11-21 13:09:51
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看天

木虫 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2012-11-21 13:09:51
楼主没有用对DNAMAN
第一步：先打开DNAMAN软件，楼主鼠标先点击左边通道1，软件窗口最下面出出现： channel 1: empty
                        channel: empty
                          ............
这是对界 ...

我吧序列 粘贴到 text中，更改后缀名为seq,可以用DNAman打开同时打开时会多出一部分关于序列的前缀，但是如果直接用以text打开，却只有序列，没有其他更多的信息。
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戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
5楼2012-11-21 13:21:24
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普通回帖

看天

木虫 (知名作家)
2楼2012-11-21 13:03:51
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看天

木虫 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2012-11-21 13:09:51
楼主没有用对DNAMAN
第一步：先打开DNAMAN软件，楼主鼠标先点击左边通道1，软件窗口最下面出出现： channel 1: empty
                        channel: empty
                          ............
这是对界 ...

看来还是不能直接复制粘贴这么省事了！
我用的是汉化版的：我选择一seq序列文件（text更改后缀名）时，怎么出现 “contain a invalid path"?
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戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
4楼2012-11-21 13:17:13
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gyesang

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【答案】应助回帖

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看天: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-11-21 14:23:38
引用回帖:
5楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-21 13:21:24
我吧序列 粘贴到 text中，更改后缀名为seq,可以用DNAman打开同时打开时会多出一部分关于序列的前缀，但是如果直接用以text打开，却只有序列，没有其他更多的信息。...

楼主直接按照我的方法来，是没有问题的。直接改后缀名还是有点问题的，.seq文件有他自己的格式吧，不止只是改后缀名这么简单，我的方法楼主有试过没？
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6楼2012-11-21 13:56:27
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看天: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-11-21 14:23:44
引用回帖:
5楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-21 13:21:24
我吧序列 粘贴到 text中，更改后缀名为seq,可以用DNAman打开同时打开时会多出一部分关于序列的前缀，但是如果直接用以text打开，却只有序列，没有其他更多的信息。...

你实在想通过改文件名或者不改文件名也是可以实现的。但是要将序列在txt文件中弄为fasta格式：
fasta序列格式如下：（自己网上去查阅）
>序列的定义信息
GATCTATATATAAT

可以将txt后缀改为.seq或者不改也可以。但是用DNAMAN加载序列是，一定要从 序列-->加载序列-->从文件夹，找到你要加载的文件，txt或者.seq均可
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7楼2012-11-21 14:06:13
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看天: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-11-21 14:23:51
引用回帖:
4楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-21 13:17:13
看来还是不能直接复制粘贴这么省事了！
我用的是汉化版的：我选择一seq序列文件（text更改后缀名）时，怎么出现 “contain a invalid path"?...

不要直接粘帖，到导入序列，如下图

123.JPG
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8楼2012-11-21 14:17:20
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看天

木虫 (知名作家)
送鲜花一朵
多谢，看来DNAman不好用
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戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
9楼2012-11-21 14:24:07
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看天: 金币+10 2012-11-21 14:28:17
引用回帖:
9楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-21 14:24:07
多谢，看来DNAman不好用

我觉得还是可以的，用熟了，就好了。
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10楼2012-11-21 14:26:39
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