应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 生物信息 » DNAMAN通道怎么用？
131/2返回列表12下一页
查看: 6296  |  回复: 12
只看楼主@他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
本帖产生 1 个 MolEPI ，点击这里进行查看

看天

木虫 (知名作家)

[求助] DNAMAN通道怎么用？

我要做的是从文献里复制、粘贴一段序列，再复制粘贴一段序列，然后两者比对，怎么做？：
DNAMAN什么通道啊 乱七八糟的，粘贴一段序列，点击下一个通道怎么还是那段序列？

[ Last edited by silicare on 2014-2-18 at 17:20 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘贴专辑推荐

【分子生物】EPI帖

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

看天

» 猜你喜欢
戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
1楼2012-11-21 12:35:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖置顶 ( 共有1个 )

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
看天: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-11-21 13:15:04
看天: 金币+10 2012-11-21 13:21:32
小丹木木: 金币+5, MolEPI+1, 真是细心又热心的虫虫啊 2012-11-21 17:23:22
楼主没有用对DNAMAN
第一步：先打开DNAMAN软件，楼主鼠标先点击左边通道1，软件窗口最下面出出现： channel 1: empty
                        channel: empty
                          ............
这是对界面的基本认识，如果把序列装到channel 1里面，empty就变了，不是empty了
那怎么将序列装到channel1呢？

第二步：楼主是从文献里复制和粘帖的，所以你貌似点了channel1，然后出现空白区域，你粘帖一下，序列进去了。实际上此时的序列并没有进channel1，你可以注意下面的状态。
所以将序列装进channel 1可以这么做，你复制了序列，然后 点File-->New，将序列粘帖进去，然后再File--》save as将序列保存一下，格式选为 .seq格式，自己命个名叫sequence 1保存到一个文件夹里面，同理序列2经过相同操作，保存为sequence 2

第三步：将刚才保存的序列1和2分别装进channel1和channel2里面，先选中channel1, 点sequence-->loading sequence-->from sequence file,找到你刚才保存的序列，序列就装进channel1了，注意下面的状态变化，序列装channel2同理

第四步：channel1和channel2序列比对，sequence--》alignment，出现个对话框，比对即可

希望对楼主有用！
赞一下(1人) 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
3楼2012-11-21 13:09:51
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

看天

木虫 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2012-11-21 13:09:51
楼主没有用对DNAMAN
第一步：先打开DNAMAN软件，楼主鼠标先点击左边通道1，软件窗口最下面出出现： channel 1: empty
                        channel: empty
                          ............
这是对界 ...

我吧序列 粘贴到 text中，更改后缀名为seq,可以用DNAman打开同时打开时会多出一部分关于序列的前缀，但是如果直接用以text打开，却只有序列，没有其他更多的信息。
赞一下(1人) 回复此楼
戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
5楼2012-11-21 13:21:24
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通回帖

看天

木虫 (知名作家)
2楼2012-11-21 13:03:51
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

看天

木虫 (知名作家)
引用回帖:
3楼: Originally posted by gyesang at 2012-11-21 13:09:51
楼主没有用对DNAMAN
第一步：先打开DNAMAN软件，楼主鼠标先点击左边通道1，软件窗口最下面出出现： channel 1: empty
                        channel: empty
                          ............
这是对界 ...

看来还是不能直接复制粘贴这么省事了！
我用的是汉化版的：我选择一seq序列文件（text更改后缀名）时，怎么出现 “contain a invalid path"?
赞一下 回复此楼
戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
4楼2012-11-21 13:17:13
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
看天: 金币+10, ★★★很有帮助 2012-11-21 14:23:38
引用回帖:
5楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-21 13:21:24
我吧序列 粘贴到 text中，更改后缀名为seq,可以用DNAman打开同时打开时会多出一部分关于序列的前缀，但是如果直接用以text打开，却只有序列，没有其他更多的信息。...

楼主直接按照我的方法来，是没有问题的。直接改后缀名还是有点问题的，.seq文件有他自己的格式吧，不止只是改后缀名这么简单，我的方法楼主有试过没？
赞一下 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
6楼2012-11-21 13:56:27
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
看天: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-11-21 14:23:44
引用回帖:
5楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-21 13:21:24
我吧序列 粘贴到 text中，更改后缀名为seq,可以用DNAman打开同时打开时会多出一部分关于序列的前缀，但是如果直接用以text打开，却只有序列，没有其他更多的信息。...

你实在想通过改文件名或者不改文件名也是可以实现的。但是要将序列在txt文件中弄为fasta格式：
fasta序列格式如下：（自己网上去查阅）
>序列的定义信息
GATCTATATATAAT

可以将txt后缀改为.seq或者不改也可以。但是用DNAMAN加载序列是，一定要从 序列-->加载序列-->从文件夹，找到你要加载的文件，txt或者.seq均可
赞一下 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
7楼2012-11-21 14:06:13
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
看天: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2012-11-21 14:23:51
引用回帖:
4楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-21 13:17:13
看来还是不能直接复制粘贴这么省事了！
我用的是汉化版的：我选择一seq序列文件（text更改后缀名）时，怎么出现 “contain a invalid path"?...

不要直接粘帖，到导入序列，如下图

123.JPG
赞一下 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
8楼2012-11-21 14:17:20
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

看天

木虫 (知名作家)
送鲜花一朵
多谢，看来DNAman不好用
赞一下 回复此楼
戒嗔怒以养肝气，省言语以养神气，多读书以养质气，顺时令以养元气，不拘节以养大气，观天变以养灵气，莫强求规于运气。
9楼2012-11-21 14:24:07
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
看天: 金币+10 2012-11-21 14:28:17
引用回帖:
9楼: Originally posted by 看天 at 2012-11-21 14:24:07
多谢，看来DNAman不好用

我觉得还是可以的，用熟了，就好了。
赞一下 回复此楼
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
10楼2012-11-21 14:26:39
 已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 看天 的主题更新
131/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫 论文翻译-EnPapers美助理教授团队-SCI英文润色
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 怎么带研究生？ +13 豆豆小小2 2024-06-20 13/650 2024-06-21 09:21 by 娴静
[硕博家园] 难道我真的要放弃吗？ +20 133456 2024-06-20 20/1000 2024-06-21 09:11 by 爱一回伤一回
[基金申请] 江苏省333人才工程 出校后被刷的概率大不大？ +4 maxbirdzhang 2024-06-19 5/250 2024-06-21 08:57 by maxbirdzhang
[有机交流] 有机反应 50+3 雨中的红玫瑰 2024-06-19 5/250 2024-06-21 08:30 by hptianyan
[有机交流] 锌粉还原反应 20+3 明宝栋 2024-06-17 5/250 2024-06-21 08:26 by hptianyan
[论文投稿] 求机械类四区sci推荐 5+4 迷茫小旷 2024-06-14 8/400 2024-06-21 08:22 by lizhengke06
[考博] 有机化学迷茫学生 +4 佛系摸鱼5 2024-06-18 7/350 2024-06-20 23:56 by 佛系摸鱼5
[论文投稿] Pattern Recognition期刊，二审审稿邀请发出一个月了，但有一个审稿人一直未接受审稿 5+3 PLVS_VLTRA 2024-06-19 5/250 2024-06-20 22:54 by holypower
[论文投稿] 投稿求助 6+3 小短腿安琪拉 2024-06-19 4/200 2024-06-20 17:40 by 不一样烟火12345
[基金申请] 青年基金会评专家到底是怎么会评的呀？主审专家是不是一般不会改动系统按函评给的顺序 5+4 他山攻玉之石 2024-06-18 18/900 2024-06-20 16:33 by 他山攻玉之石
[论文投稿] 投稿求助 +4 平凡的日子 2024-06-19 5/250 2024-06-20 16:24 by yueyueyue@
[找工作] 高校两个offer选择 +15 cowox2021 2024-06-18 16/800 2024-06-20 15:24 by ase123456
[硕博家园] 豫北虫友互识 +11 xuhongli903 2024-06-18 12/600 2024-06-20 13:32 by 1429524838
[基金申请] 太卷了 +14 laoyuefubio 2024-06-17 27/1350 2024-06-20 09:52 by htjwqy
[基金申请] 希望今年自己国自然面上项目和老婆青年项目能中！ +10 恐龙爸爸 2024-06-14 10/500 2024-06-20 08:42 by jsguo4127
[基金申请] 面上博士后 +3 jsqy 2024-06-19 3/150 2024-06-19 17:58 by bxwisdom_886
[论文投稿] 审稿 +5 香瓜木香 2024-06-19 6/300 2024-06-19 17:44 by xli1984
[基金申请] 博后基金刷到的BUG,图片来的更直观 +15 carolloo 2024-06-17 16/800 2024-06-19 09:42 by msjy
[论文投稿] 投稿被一个审稿人恶意评审了怎么样？ +5 1chen 2024-06-14 7/350 2024-06-15 23:15 by xy66xy
[基金申请] 博后基金，以往的结果点不开，怎么回事呢？最后一次机会了，两次都没中前面。 +7 kyukitu 2024-06-14 13/650 2024-06-15 06:46 by 我是王小帅
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭