应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » LAMMPS/DL_POLY » LAMMPS并行计算的问题（cpu——time关系）
51/1返回列表
查看: 4823  |  回复: 17
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

lbh_xt

新虫 (小有名气)

[求助] LAMMPS并行计算的问题（cpu——time关系）

刚买了个服务器，6核4线程的，安装好并行版lammps后运行如下：
mpirun -np 1 ./lmp mpirun -np 2 ./lmp mpirun -np 3 ./lmp ...
我们进行了测试了time  —— cpu的数目关系，如上传图片


（1）怎么发现24个cpu全用上，计算所用的时间和2个cpu 的一样，这是什么原因啊。
（2）随着cpu从1到24变化，时间time会出现波动，一会大一会小的。测试结果是随机的还是差不多都一样呢？请问正常的情况应该是什么样子呢？
（3）有朋友说是因为体系大小的原因，请问一下用过lammps并行版的牛人们，你们是怎么测试和分配的呢？
（4）有没有好的软件专门进行并行测试的？（我感觉是不是因为计算机并行没有装好）

cpu-time.jpg
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

第一性原理

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
安静
1楼 2012-11-19 18:55:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-11-20 22:00:34
lbh_xt: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢高手指点 2012-11-21 13:46:42
引用回帖:
3楼: Originally posted by lbh_xt at 2012-11-20 09:41:19
单位是秒，我只是写了个小程序用并行版的测试一下。

我不是很懂这些，请问多线程不是也有那么多cpu吗，我的同学的服务器也是这个样子的，如果不用多线程的话，那么就只能有六个核算了嘛？...

参考这个回帖
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2309639&page=1#pid1464069
你的测试样本确实太小了。
赞一下 回复此楼
5楼2012-11-20 14:24:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答

043114076

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-20 09:53:31
lbh_xt: 金币+2, ★★★很有帮助, 谢谢高手指点哈 2012-11-21 13:49:03
对于科学计算来说多线程用不着，要关闭掉。
另外你的时间单位是什么？
赞一下 回复此楼
2楼2012-11-20 08:55:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lbh_xt

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by 043114076 at 2012-11-20 08:55:31
对于科学计算来说多线程用不着，要关闭掉。
另外你的时间单位是什么？

单位是秒，我只是写了个小程序用并行版的测试一下。

我不是很懂这些，请问多线程不是也有那么多cpu吗，我的同学的服务器也是这个样子的，如果不用多线程的话，那么就只能有六个核算了嘛？
赞一下 回复此楼
安静
3楼2012-11-20 09:41:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+3, 谢谢~ 2012-11-20 22:00:26
lbh_xt: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢高手指点 2012-11-21 13:46:56
写个小程序就想比较计算速度，有点儿不太合适吧。
如果你一个体系很小的体系，用太多的CPU，反而浪费很多时间在信息的传递上，
并行计算的优势是大体系分块算。
我也坐过类似的测试：
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-20 09:57:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 18 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +15 羊腰板 2026-08-21 16/800 2026-08-23 10:45 by process2012
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 9/450 2026-08-23 10:44 by IXZuIJ2Q7OVy
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +12 大萍1987 2026-08-20 14/700 2026-08-23 10:30 by wrm
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +4 简单化xn 2026-08-22 8/400 2026-08-23 07:20 by ilovexiaobin
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-21 10/500 2026-08-23 07:17 by OEbVnUOu01ol
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 7/350 2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
[论文投稿] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 2JOx3r2CYEgw 2026-08-22 5/250 2026-08-23 03:52 by OEbVnUOu01ol
[基金申请] 93BebMhtakh前后11位开头都是大写 +7 且听虎啸 2026-08-17 8/400 2026-08-22 21:55 by 医学老男孩
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +24 yaoyewhu2008 2026-08-20 26/1300 2026-08-22 17:43 by kammury
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +13 ziyangfang 2026-08-19 16/800 2026-08-22 17:08 by WH3796
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16 医学老男孩 2026-08-20 20/1000 2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
[基金申请] 科研孤儿太难了 +17 我4大白菜 2026-08-20 18/900 2026-08-21 20:57 by zhangev
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7 angus9576 2026-08-17 12/600 2026-08-21 13:38 by weiyin
[论文投稿] 投稿咨询 +5 wwm09 2026-08-17 7/350 2026-08-21 10:11 by 期刊论文帮手
[基金申请] 估计是周四 +3 archvillain 2026-08-18 3/150 2026-08-21 01:48 by jnhyjjm
[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18 基诺咪客 2026-08-17 23/1150 2026-08-20 17:19 by Godzela
[基金申请] 朋友圈看到的 +6 wangzilk 2026-08-18 8/400 2026-08-19 10:55 by Haru815
[基金申请] 今天维护系统维护 祝所有人 高中 +8 gjjjzhong 2026-08-18 9/450 2026-08-18 13:01 by 家与远方
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭