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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 新手求通过marker估计下dna浓度
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fddyn

金虫 (小有名气)

[求助] 新手求通过marker估计下dna浓度

用传统方法手提的土壤微生物dna，杂质含量太高测浓度的ND-1000分光光度计测出来不准，故想通过跑胶与marker比较估计个大概浓度，也好知道纯化的回收率，谢谢
Q1--Q5 均为qiagen胶回收试剂盒纯化后的样品，marker（M）在中间，1--8为粗提产物
样品上样量为 ：5ul
marker上样量为：5ul
marker用的是 Lambda DNA/Hind III Marker，上样6ul时 23130bp （最后那条）是238.4ng，9416bp（倒数第二条）是97.1ng

2012.11.09---.JPG
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1楼 2012-11-16 19:22:15
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回帖支持 ( 显示支持度最高的前 50 名 )

tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
可以下载一个ImageJ软件，很好用，在小木虫上应该可以下载到，祝你好运。
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coasttocoast。
5楼2012-11-17 10:45:08
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普通回帖

fddyn

金虫 (小有名气)
再补充点，跑的是0.5%的琼脂糖胶
为什么纯化后比纯化前看上去片段大呐
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2楼2012-11-16 19:24:10
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cicelyzh

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fddyn: 金币+3, ★有帮助 2012-11-17 23:47:00
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流 2012-11-19 13:59:23
marker9kb与23kb的带跑得不是很开，而且浓度明显比样品高。可以考虑少上点marker，电泳时间长一点再看。从目前的粗略估计，大概浓度在大约6ng/ul。
纯化前的样品杂质多，浓度较高，条带笑脸，电泳的表观分子量稍微偏小是很正常的。
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3楼2012-11-17 08:00:16
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elbo

金虫 (小有名气)
貌似片段小于23kb，请问胶上面的标记是怎么弄的，谢谢。
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4楼2012-11-17 08:04:35
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elbo

金虫 (小有名气)
引用回帖:
5楼: Originally posted by tupac225 at 2012-11-17 10:45:08
可以下载一个ImageJ软件，很好用，在小木虫上应该可以下载到，祝你好运。

用QUALITY ONE不能那样标记吗
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6楼2012-11-17 11:36:09
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大海一孤舟

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
fddyn: 金币+2, ★★★很有帮助 2012-11-17 23:46:45
照胶的程序里面有浓度比较的软件，可以自己学习一下。
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7楼2012-11-17 11:42:01
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fddyn

金虫 (小有名气)
内容已删除
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8楼2012-11-17 23:42:58
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fddyn

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by elbo at 2012-11-17 08:04:35
貌似片段小于23kb，请问胶上面的标记是怎么弄的，谢谢。

我就是在画图中加的，没上面说的那么复杂，不过QUALITY ONE好像也能标记
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9楼2012-11-17 23:44:08
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fddyn

金虫 (小有名气)
引用回帖:
7楼: Originally posted by 大海一孤舟 at 2012-11-17 11:42:01
照胶的程序里面有浓度比较的软件，可以自己学习一下。

你好，请问你说的是ImageJ软件吗？才开始用，不太会，就想以版上虫友估的为基础判断软件用的对否
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10楼2012-11-17 23:46:33
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