24小时热门版块排行榜

返回列表

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

倩430

铁虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 177.5
散金: 61
红花: 2
帖子: 158
在线: 62.2小时
虫号: 1691327
注册: 2012-03-14
专业: 药物设计与药物信息

[求助] 范德华能量分解到小分子的每个原子上

对于蛋白小分子复合物，我想把二者的范德华能量分解到小分子的每个原子上。请问有应该怎么做。希望好心人帮助

回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

amber

» 猜你喜欢

大佬帮着分析今年的评审意见？该课题连续申请了三年了，明年要不要换个方向。已经有11人回复
两块石头已经有10人回复
广西大学-广州大学招聘博士后欢迎广大优秀人才！！！已经有8人回复
科研人应该花精力去思考如何解决问题，而不是去凝练问题已经有19人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急已经有9人回复
售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急已经有15人回复
面上没中，邀请各位路过的虫友分析一下分数已经有13人回复
初秋的晨风已经有6人回复
学科评审组评审是指会评吗？已经有9人回复
Ei源刊怎么投已经有4人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

Multiwfn支持的弱相互作用的分析方法概览已经有10人回复
【sobereva个人文集】电子定域性的图形分析已经有56人回复

1楼 2012-11-14 22:05:27

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

倩430

铁虫 (小有名气)

应助: 3 (幼儿园)
金币: 177.5
散金: 61
红花: 2
帖子: 158
在线: 62.2小时
虫号: 1691327
注册: 2012-03-14
专业: 药物设计与药物信息

引用回帖:

2楼: Originally posted by 043114076 at 2012-11-15 10:43:14
我自己的理解可以这样来做：计算第i个原子对范德华能量的贡献，就是把i与其他原子的vdw能量加起来再除以2。除以2的原因是重复计算了能量，如果不除的话所有原子的vdw能量的加和是真正vdw能量的两倍。
具体实现的话 ...

具体用什么工具可以实现呢。我是用amber跑的md