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448935271

银虫 (小有名气)

[求助] 序列

我刚刚接触分子生物学,想要问一下如果要自己设计一段引物,该从哪里去寻找模板序列的排列顺序呢?
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万物皆有毒,只要剂量足
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shsDerek

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
什么叫模板序列排列顺序?你可以用primer6试一下
2楼2012-11-13 11:15:46
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
448935271: 金币+1, 有帮助 2012-11-13 14:59:30
448935271: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-11-13 19:50:44
你可以去NCBI上去找序列,你也可以找相关文献看看有没有基因序列号再到NCBI找找看
hehe
3楼2012-11-13 11:19:01
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448935271

银虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by lvbobo823 at 2012-11-13 11:19:01
你可以去NCBI上去找序列,你也可以找相关文献看看有没有基因序列号再到NCBI找找看

给个网址好吗
万物皆有毒,只要剂量足
4楼2012-11-13 14:59:20
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448935271

银虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by shsDerek at 2012-11-13 11:15:46
什么叫模板序列排列顺序?你可以用primer6试一下

要根据模板来设计引物的呀,那我连模板的序列也不知道肯定是不行的
万物皆有毒,只要剂量足
5楼2012-11-13 15:00:14
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秋雨心寒

铜虫 (初入文坛)

448935271: 回帖置顶 2012-11-19 10:54:24
设计引物首先需要把目的基因的序列给拿到,你可以去esemble的网站拿到,然后用相关引物设计软件,比如楼上说到的primer6,最后去NCBI上BLAST一下,看看特异性如何。一般流程是这样的。
6楼2012-11-19 10:34:22
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448935271

银虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by 秋雨心寒 at 2012-11-19 10:34:22
设计引物首先需要把目的基因的序列给拿到,你可以去esemble的网站拿到,然后用相关引物设计软件,比如楼上说到的primer6,最后去NCBI上BLAST一下,看看特异性如何。一般流程是这样的。

esemble的具体网址是多少呢?
万物皆有毒,只要剂量足
7楼2012-11-19 10:53:32
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秋雨心寒

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 448935271 at 2012-11-19 10:53:32
esemble的具体网址是多少呢?...

http://asia.ensembl.org/index.html
度娘跟谷歌那么强大,楼主要没事多和他们玩玩哦~~~~
8楼2012-11-21 19:33:23
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gyesang

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【答案】应助回帖


448935271: 金币+1, 有帮助 2012-11-22 14:14:58
引用回帖:
4楼: Originally posted by 448935271 at 2012-11-13 14:59:20
给个网址好吗...

NCBI网址:

www.ncbi.nlm.nih.gov

楼主加油啊!
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
9楼2012-11-21 22:39:06
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jl860822

金虫 (正式写手)


【答案】应助回帖

知道基因的名称,查一下NCBI的核酸序列,复制出来,用软件来设计引物,还可以顺便看一下发表该序列的文章
10楼2012-11-22 09:03:06
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