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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 序列
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448935271

银虫 (小有名气)

[求助] 序列

我刚刚接触分子生物学，想要问一下如果要自己设计一段引物，该从哪里去寻找模板序列的排列顺序呢？
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万物皆有毒，只要剂量足
1楼 2012-11-13 11:06:07
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回帖置顶 ( 共有1个 )

秋雨心寒

铜虫 (初入文坛)
448935271: 回帖置顶 2012-11-19 10:54:24
设计引物首先需要把目的基因的序列给拿到，你可以去esemble的网站拿到，然后用相关引物设计软件，比如楼上说到的primer6，最后去NCBI上BLAST一下，看看特异性如何。一般流程是这样的。
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6楼2012-11-19 10:34:22
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普通回帖

shsDerek

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
什么叫模板序列排列顺序？你可以用primer6试一下
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2楼2012-11-13 11:15:46
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lvbobo823

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
448935271: 金币+1, ★有帮助 2012-11-13 14:59:30
448935271: 金币+1, ★★★很有帮助 2012-11-13 19:50:44
你可以去NCBI上去找序列，你也可以找相关文献看看有没有基因序列号再到NCBI找找看
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hehe
3楼2012-11-13 11:19:01
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448935271

银虫 (小有名气)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lvbobo823 at 2012-11-13 11:19:01
你可以去NCBI上去找序列，你也可以找相关文献看看有没有基因序列号再到NCBI找找看

给个网址好吗
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万物皆有毒，只要剂量足
4楼2012-11-13 14:59:20
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448935271

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by shsDerek at 2012-11-13 11:15:46
什么叫模板序列排列顺序？你可以用primer6试一下

要根据模板来设计引物的呀，那我连模板的序列也不知道肯定是不行的
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万物皆有毒，只要剂量足
5楼2012-11-13 15:00:14
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448935271

银虫 (小有名气)
引用回帖:
6楼: Originally posted by 秋雨心寒 at 2012-11-19 10:34:22
设计引物首先需要把目的基因的序列给拿到，你可以去esemble的网站拿到，然后用相关引物设计软件，比如楼上说到的primer6，最后去NCBI上BLAST一下，看看特异性如何。一般流程是这样的。

esemble的具体网址是多少呢？
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万物皆有毒，只要剂量足
7楼2012-11-19 10:53:32
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秋雨心寒

铜虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

引用回帖:
7楼: Originally posted by 448935271 at 2012-11-19 10:53:32
esemble的具体网址是多少呢？...

http://asia.ensembl.org/index.html
度娘跟谷歌那么强大，楼主要没事多和他们玩玩哦~~~~
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8楼2012-11-21 19:33:23
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gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★
448935271: 金币+1, ★有帮助 2012-11-22 14:14:58
引用回帖:
4楼: Originally posted by 448935271 at 2012-11-13 14:59:20
给个网址好吗...

NCBI网址：

www.ncbi.nlm.nih.gov

楼主加油啊！
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学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
9楼2012-11-21 22:39:06
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jl860822

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

知道基因的名称，查一下NCBI的核酸序列，复制出来，用软件来设计引物，还可以顺便看一下发表该序列的文章
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10楼2012-11-22 09:03:06
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