应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 2D-scan求助
191/2返回列表12下一页
查看: 1658  |  回复: 18
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

xiemin8761

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 2D-scan求助

根据一篇文章，我尝试用2D-scan扫描一个分子，计算的都失败了不知什么原因，请各位高手指教。
我的输入文件是：
# opt(maxcyc=100,addredundant) upbe1pbe/6-31+g* scf=(qc,nosymm) geom=connectivity

Title Card Required

0 1
C              
H                  1            B1
H                  1            B2    2            A1
H                  1            B3    2            A2    3            D1    0
C                  1            B4    2            A3    3            D2    0
C                  5            B5    1            A4    2            D3    0
H                  6            B6    5            A5    1            D4    0
H                  6            B7    5            A6    1            D5    0
H                  6            B8    5            A7    1            D6    0
O                  5            B9    1            A8    6            D7    0
O                 10           B10    5            A9    1            D8    0
H                 11           B11   10           A10    5            D9    0
H                 11           B12   10           A11    5           D10    0

   B1             1.09041428
   B2             1.09834559
   B3             1.09588262
   B4             1.50403959
   B5             1.48882226
   B6             1.08944121
   B7             1.10029571
   B8             1.09377481
   B9             1.22943504
   B10            2.25904576
   B11            0.97274001
   B12            0.97271156
   A1           109.92873208
   A2           111.12632155
   A3           112.20520707
   A4           120.67941448
   A5           111.38556342
   A6           106.61508768
   A7           109.59825862
   A8           115.77988206
   A9           112.26541245
   A10           97.56795174
   A11           99.56438207
   D1          -119.61623552
   D2           118.83803220
   D3           169.57863237
   D4           161.78293646
   D5           -79.13473791
   D6            36.72209100
   D7          -179.31990089
   D8          -177.29025062
   D9           129.69444934
   D10         -123.23665237

1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 5 1.0
2
3
4
5 6 1.0 10 2.0
6 7 1.0 8 1.0 9 1.0
7
8
9
10
11 12 1.0 13 1.0
12
13

7 11 2.33673 s 10 -0.153
7 10 2.5872 s 10 -0.178

输出文件显示的错误为：

Iteration100 RMS(Cart)=  0.00002839 RMS(Int)=  0.03650170
New curvilinear step not converged.
RedCar failed.
Error termination via Lnk1e in /usr/local/intel/g03/l103.exe at Thu Nov  8 21:54:38 2012.
Job cpu time:  0 days  3 hours  1 minutes 54.0 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=     29 Int=      0 D2E=      0 Chk=     19 Scr=      1
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

过渡态计算

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2012-11-12 11:22:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiemin8761

铁杆木虫 (著名写手)
还有时候出错显示
。。。
Iteration 96 RMS(Cart)=  0.00018544 RMS(Int)=  0.47065122
Iteration 97 RMS(Cart)=  0.00016406 RMS(Int)=  0.47055968
Iteration 98 RMS(Cart)=  0.00014510 RMS(Int)=  0.47047863
Iteration 99 RMS(Cart)=  0.00012829 RMS(Int)=  0.47040689
Iteration100 RMS(Cart)=  0.00011339 RMS(Int)=  0.47034342
New curvilinear step not converged.
RedCar failed in NewRed.
Error termination via Lnk1e in /usr/local/intel/g03/l101.exe at Mon Nov 12 12:59:51 2012.
Job cpu time:  0 days  0 hours  0 minutes  3.3 seconds.
File lengths (MBytes):  RWF=      8 Int=      0 D2E=      0 Chk=      1 Scr=      1
赞一下 回复此楼
2楼2012-11-12 12:08:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
你先看一下这个是否为优化好的体系
赞一下 回复此楼
3楼2012-11-12 19:43:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiemin8761

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-11-12 19:43:50
你先看一下这个是否为优化好的体系

已经是优化好了的，而且我用高斯09计算他竟然可以计算完成，但是不scan奇怪了。
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-13 08:13:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
xiemin8761: 金币+1 2012-11-14 12:18:49
你重新提交下，103错误时gaussian的一个bug
赞一下 回复此楼
5楼2012-11-13 11:12:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiemin8761

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-11-13 11:12:59
你重新提交下，103错误时gaussian的一个bug

不明白，重新提交啥意思？
赞一下 回复此楼
6楼2012-11-13 12:12:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lishijunzong

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
xiemin8761: 金币+1, ★有帮助 2012-11-14 12:19:50
引用回帖:
6楼: Originally posted by xiemin8761 at 2012-11-13 12:12:07
不明白，重新提交啥意思？...

之前的作业是系统错误，你从新提交作业就行
赞一下 回复此楼
7楼2012-11-13 18:40:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xy00083789

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiemin8761: 金币+1, ★有帮助 2012-11-14 12:19:07
xiemin8761: 金币+3, ★★★很有帮助, 我再看看能不能算。谢谢 2012-11-14 16:33:22
楼主，原因在于扫描坐标与内坐标不对应。
是这样：你在设置scan的时候
7 11 2.33673 s 10 -0.153
7 10 2.5872 s 10 -0.178
是设置的H（7） 和 两个O（10,11）的键长扫描。但是你的内坐标定义里面 两个O分别和 5,10成键，所以无法识别被扫描的坐标，造成错误。
解决方法是，在gjf的atomlist里面先构造好你需要的键长，之后再在modredundant里面，定义对该键长进行扫描。
赞一下 回复此楼
欢迎交流zhongyue.yang@yahoo.cn
8楼2012-11-13 18:58:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiemin8761

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
8楼: Originally posted by xy00083789 at 2012-11-13 18:58:56
楼主，原因在于扫描坐标与内坐标不对应。
是这样：你在设置scan的时候
7 11 2.33673 s 10 -0.153
7 10 2.5872 s 10 -0.178
是设置的H（7） 和 两个O（10,11）的键长扫描。但是你的内坐标定义里面 两个O分别和 5 ...

能不能具体一点，怎么构造新的键长呢？奇怪的是有一次我计算2D-scan竟然成功了，后来做的2D-scan都成功不了，不知道啥原因。谢谢您的应助
赞一下 回复此楼
9楼2012-11-14 12:15:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiemin8761

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by lishijunzong at 2012-11-13 18:40:15
之前的作业是系统错误，你从新提交作业就行...

是算一次错误了之后再提交计算就能算出来？那之前的要删除吗？之前的要保留chk文件吗？能不能再详细一点啊谢谢！
赞一下 回复此楼
10楼2012-11-14 12:18:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xiemin8761 的主题更新
191/2返回列表12下一页
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ASdOkHsho7FD 2026-08-28 6/300 2026-08-29 07:46 by gy1nBQXYQJqL
[基金申请] 投票:  有多少人是今天查系统知道结果的？ +16 爱看书的可乐 2026-08-26 18/900 2026-08-29 07:32 by winsaint
[基金申请] 2026年叶企孙基金 +4 bud_bud 2026-08-27 7/350 2026-08-29 07:23 by foolishmani
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +8 苏东坡二世 2026-08-23 8/400 2026-08-28 14:41 by lkforward
[基金申请] 麻烦专家们看看评委们的意见（F口面上） +4 gdd2018 2026-08-28 9/450 2026-08-28 14:22 by jklily
[基金申请] 基金系统什么内容也没有 30+4 winsaint 2026-08-27 9/450 2026-08-28 11:06 by maolC
[基金申请] 怎么查啊 +6 huang1991js 2026-08-26 6/300 2026-08-28 08:42 by winsaint
[基金申请] 哪位高人中了，把查询到的截图贴出来让我看看，让我长长见识 +5 yuleib84 2026-08-26 6/300 2026-08-28 00:02 by yudaoqian88
[基金申请] 申请删除本帖 +6 lyz123lyz 2026-08-27 7/350 2026-08-27 17:31 by 宁静致远sy
[基金申请] 为什么 国际(地区)合作与交流项目 没有放榜？ 10+3 majunge000 2026-08-26 11/550 2026-08-27 08:42 by 北京莱茵编辑
[基金申请] 我不理解！ +15 Edward_pc 2026-08-26 23/1150 2026-08-26 20:34 by zzuzxg
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +7 process2012 2026-08-23 10/500 2026-08-26 19:23 by hmhminy
[基金申请] 2026年8月25日国自然放榜前突然收到列入评审专家邮件，有关系吗？ +25 木水思豆 2026-08-25 28/1400 2026-08-26 14:53 by draco1987
[基金申请] 能否退出参与的面上项目解除限项 +23 koalala 2026-08-24 26/1300 2026-08-26 14:29 by 宝贝虫子
[基金申请] 国际合作可查了，中了面上 (EPI+1)(金币+50) +18 Ldrop2023 2026-08-26 18/900 2026-08-26 11:15 by cmrandy
[基金申请] 系统进不去 +4 yanglien 2026-08-26 5/250 2026-08-26 11:10 by wenfengw83
[基金申请] 项目信息和经费信息在系统里都可以看到了 +6 wittyboy 2026-08-26 14/700 2026-08-26 10:55 by wittyboy
[职场人生] 学生撞见辅导员送外卖，第二天全班都沉默了 +3 鲸鱼融金_浙江_� 2026-08-22 3/150 2026-08-26 09:01 by zzuzxg
[基金申请] 在坚冰还盖着北海的时候，我看到了怒放的梅花。 (金币+10) +6 ziyangfang 2026-08-25 9/450 2026-08-25 20:26 by huagongfeihu
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭