| 查看: 1624 | 回复: 18 | |||
xiemin8761铁杆木虫 (著名写手)
|
[求助]
2D-scan求助
|
|
根据一篇文章，我尝试用2D-scan扫描一个分子，计算的都失败了不知什么原因，请各位高手指教。 我的输入文件是： # opt(maxcyc=100,addredundant) upbe1pbe/6-31+g* scf=(qc,nosymm) geom=connectivity Title Card Required 0 1 C H 1 B1 H 1 B2 2 A1 H 1 B3 2 A2 3 D1 0 C 1 B4 2 A3 3 D2 0 C 5 B5 1 A4 2 D3 0 H 6 B6 5 A5 1 D4 0 H 6 B7 5 A6 1 D5 0 H 6 B8 5 A7 1 D6 0 O 5 B9 1 A8 6 D7 0 O 10 B10 5 A9 1 D8 0 H 11 B11 10 A10 5 D9 0 H 11 B12 10 A11 5 D10 0 B1 1.09041428 B2 1.09834559 B3 1.09588262 B4 1.50403959 B5 1.48882226 B6 1.08944121 B7 1.10029571 B8 1.09377481 B9 1.22943504 B10 2.25904576 B11 0.97274001 B12 0.97271156 A1 109.92873208 A2 111.12632155 A3 112.20520707 A4 120.67941448 A5 111.38556342 A6 106.61508768 A7 109.59825862 A8 115.77988206 A9 112.26541245 A10 97.56795174 A11 99.56438207 D1 -119.61623552 D2 118.83803220 D3 169.57863237 D4 161.78293646 D5 -79.13473791 D6 36.72209100 D7 -179.31990089 D8 -177.29025062 D9 129.69444934 D10 -123.23665237 1 2 1.0 3 1.0 4 1.0 5 1.0 2 3 4 5 6 1.0 10 2.0 6 7 1.0 8 1.0 9 1.0 7 8 9 10 11 12 1.0 13 1.0 12 13 7 11 2.33673 s 10 -0.153 7 10 2.5872 s 10 -0.178 输出文件显示的错误为： Iteration100 RMS(Cart)= 0.00002839 RMS(Int)= 0.03650170 New curvilinear step not converged. RedCar failed. Error termination via Lnk1e in /usr/local/intel/g03/l103.exe at Thu Nov 8 21:54:38 2012. Job cpu time: 0 days 3 hours 1 minutes 54.0 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 29 Int= 0 D2E= 0 Chk= 19 Scr= 1 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 过渡态计算 |
» 猜你喜欢
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有212人回复
-
调剂招生
已经有1人回复
-
实际气体内压强的微观机制或将改写--------从一个基本的力学佯谬说起
已经有2人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有0人回复
-
调剂招生
已经有5人回复
-
招收0703开头的学硕调剂生 线上复试
已经有5人回复
-
湖北文理学院材料与化工专硕还有调剂名额，欢迎大家推荐考生！
已经有1人回复
-
面上再次挂了，太难了，躺也躺不了，倦也卷不过，小学校之殇！
已经有31人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
xiemin8761
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 8666
- 散金: 188
- 红花: 2
- 帖子: 2213
- 在线: 509.5小时
- 虫号: 769782
- 注册: 2009-05-14
- 性别: GG
- 专业: 化学动力学
|
还有时候出错显示 。。。 Iteration 96 RMS(Cart)= 0.00018544 RMS(Int)= 0.47065122 Iteration 97 RMS(Cart)= 0.00016406 RMS(Int)= 0.47055968 Iteration 98 RMS(Cart)= 0.00014510 RMS(Int)= 0.47047863 Iteration 99 RMS(Cart)= 0.00012829 RMS(Int)= 0.47040689 Iteration100 RMS(Cart)= 0.00011339 RMS(Int)= 0.47034342 New curvilinear step not converged. RedCar failed in NewRed. Error termination via Lnk1e in /usr/local/intel/g03/l101.exe at Mon Nov 12 12:59:51 2012. Job cpu time: 0 days 0 hours 0 minutes 3.3 seconds. File lengths (MBytes): RWF= 8 Int= 0 D2E= 0 Chk= 1 Scr= 1 |
2楼2012-11-12 12:08:23
lishijunzong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 214 (大学生)
- 金币: 5034
- 红花: 10
- 帖子: 574
- 在线: 195.1小时
- 虫号: 1121020
- 注册: 2010-10-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
3楼2012-11-12 19:43:50
xiemin8761
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 8666
- 散金: 188
- 红花: 2
- 帖子: 2213
- 在线: 509.5小时
- 虫号: 769782
- 注册: 2009-05-14
- 性别: GG
- 专业: 化学动力学
4楼2012-11-13 08:13:48
lishijunzong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 214 (大学生)
- 金币: 5034
- 红花: 10
- 帖子: 574
- 在线: 195.1小时
- 虫号: 1121020
- 注册: 2010-10-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2012-11-13 11:12:59
xiemin8761
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 8666
- 散金: 188
- 红花: 2
- 帖子: 2213
- 在线: 509.5小时
- 虫号: 769782
- 注册: 2009-05-14
- 性别: GG
- 专业: 化学动力学
6楼2012-11-13 12:12:07
lishijunzong
铁杆木虫 (正式写手)
- 应助: 214 (大学生)
- 金币: 5034
- 红花: 10
- 帖子: 574
- 在线: 195.1小时
- 虫号: 1121020
- 注册: 2010-10-13
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
7楼2012-11-13 18:40:15
xy00083789
金虫 (小有名气)
- 应助: 8 (幼儿园)
- 金币: 932.7
- 散金: 4
- 帖子: 82
- 在线: 124.6小时
- 虫号: 1157021
- 注册: 2010-11-27
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
xiemin8761: 金币+1, ★有帮助 2012-11-14 12:19:07
xiemin8761: 金币+3, ★★★很有帮助, 我再看看能不能算。谢谢 2012-11-14 16:33:22
感谢参与，应助指数 +1
xiemin8761: 金币+1, ★有帮助 2012-11-14 12:19:07
xiemin8761: 金币+3, ★★★很有帮助, 我再看看能不能算。谢谢 2012-11-14 16:33:22
|
楼主，原因在于扫描坐标与内坐标不对应。 是这样：你在设置scan的时候 7 11 2.33673 s 10 -0.153 7 10 2.5872 s 10 -0.178 是设置的H（7） 和 两个O（10,11）的键长扫描。但是你的内坐标定义里面 两个O分别和 5,10成键，所以无法识别被扫描的坐标，造成错误。 解决方法是，在gjf的atomlist里面先构造好你需要的键长，之后再在modredundant里面，定义对该键长进行扫描。 |
8楼2012-11-13 18:58:56
xiemin8761
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 8666
- 散金: 188
- 红花: 2
- 帖子: 2213
- 在线: 509.5小时
- 虫号: 769782
- 注册: 2009-05-14
- 性别: GG
- 专业: 化学动力学
9楼2012-11-14 12:15:30
xiemin8761
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 13 (小学生)
- 金币: 8666
- 散金: 188
- 红花: 2
- 帖子: 2213
- 在线: 509.5小时
- 虫号: 769782
- 注册: 2009-05-14
- 性别: GG
- 专业: 化学动力学
10楼2012-11-14 12:18:13
100