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20111987

金虫 (正式写手)

[求助] 如何辨别引物之间是否能够形成引物二聚体

以下是我用到的两对引物序列,大家帮忙看一下是不是很容易形成引物二聚体啊,为什么我试了各种方法,扩增出来的都只有二聚体没有目的条带,但是内参却扩增出来的很好,不知道什么原因呀
5′-AGCATCATGCCACCTACGTGA-3′
5′-CACCACCATTGAATTTCAGCG-3′


5′CGAGCTCGAACCTGTAATCAGCCATG 3′
5′GGGGTACCGCTGATATTCTTCCAGTTG 3′
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dsm1026

金虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
别人文献里的模板跟你的模板是一样的吗?还有。你的引物内部之间可能会形成发夹结构。
4楼2012-11-10 09:03:17
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tupac225

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
20111987: 金币+3, 有帮助 2012-11-12 08:10:10
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-11-12 14:35:33
自己看看引物3'端末端是否有互补序列,这样的话容易造成引物以引物为模板进行延伸,行成引物二聚体。
我觉得还是你的引物设计的不好,
coasttocoast。
2楼2012-11-09 23:21:39
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20111987

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by tupac225 at 2012-11-09 23:21:39
自己看看引物3'端末端是否有互补序列,这样的话容易造成引物以引物为模板进行延伸,行成引物二聚体。
我觉得还是你的引物设计的不好,

可是我的引物是按照文献中用过的引物合成的呀,我就是不明白为什么人家论文里面能扩增出来,而我却做不出来呢。
3楼2012-11-10 08:09:21
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20111987

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by dsm1026 at 2012-11-10 09:03:17
别人文献里的模板跟你的模板是一样的吗?还有。你的引物内部之间可能会形成发夹结构。

不是一样的,但是处理是相同的,感觉我的模板肯定有该基因的,不知道为何扩增不出来。
5楼2012-11-12 08:12:41
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