24小时热门版块排行榜    

查看: 961  |  回复: 7

ning145301

金虫 (正式写手)

[求助] 想问一下甲基化的研究和基因表达的研究有什么不同

甲基化的研究是识别不同样本间的差异甲基化区域,基因表达的研究也是识别不同样本间的差异表达基因,这二者有什么本质的不同吗?研究基因表达的方法能否直接用到甲基化数据的研究中呢?
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cesjf

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 谢谢分享经验 2012-11-09 08:19:06
一般来说,甲基化会抑制基因表达,但这需要具体问题具体分析。如果都是基于芯片的数据,研究基因表达的方法当然可以用到甲基化数据上。现在也有基于测序的基因表达(RNA-Seq)和甲基化(比如Bisulfite sequencing)数据。

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2012-11-08 02:18:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ning145301

金虫 (正式写手)

送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by cesjf at 2012-11-08 02:18:29
一般来说,甲基化会抑制基因表达,但这需要具体问题具体分析。如果都是基于芯片的数据,研究基因表达的方法当然可以用到甲基化数据上。现在也有基于测序的基因表达(RNA-Seq)和甲基化(比如Bisulfite sequencing)数据 ...

谢谢,我还是有点迷茫,既然方法可以用,那对于做方法的人来说,好像研究甲基化就没有意义了
3楼2012-11-08 08:42:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cesjf

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

个人感觉基于芯片的甲基化数据方法分析可能没有多大意义了。但基于测序的甲基化数据方面应该还是可以继续做下去的。
4楼2012-11-08 23:36:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ning145301

金虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by cesjf at 2012-11-08 23:36:04
个人感觉基于芯片的甲基化数据方法分析可能没有多大意义了。但基于测序的甲基化数据方面应该还是可以继续做下去的。

基于测序的甲基化数据可以在公共数据库上下载吗?我刚开始接触这一块,还望高手能指点一二,
5楼2012-11-09 08:42:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

竹子小小

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
基因的表达不表达又不光是甲基化控制。研究甲基化不过是研究基因表达的其中一种机制。你当小分子RNA和其它各种酶不存在么。你只研究甲基化一方面也是可以的。
6楼2012-11-09 10:42:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ning145301

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cesjf at 2012-11-08 02:18:29
一般来说,甲基化会抑制基因表达,但这需要具体问题具体分析。如果都是基于芯片的数据,研究基因表达的方法当然可以用到甲基化数据上。现在也有基于测序的基因表达(RNA-Seq)和甲基化(比如Bisulfite sequencing)数据 ...

我还想问一下,基于测序的甲基化数据的格式是怎样的?
基于芯片数据的,是每个CpG位点对应一个甲基化水平,那么基于测序的数据是什么样的呢?谢谢
7楼2012-11-09 11:00:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cesjf

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ning145301: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢你 2012-11-10 08:59:23
你可以看看Human DNA methylomes at base resolution show widespread epigenomic differences, Nature 462, 315-322 (19 November 2009)这篇文章。这是该领域经典文章(可以算是第一篇关于哺乳动物的高分辨率甲基化图谱的文章),相关数据可以在http://neomorph.salk.edu/human_methylome/index.html上下载。
8楼2012-11-10 00:15:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ning145301 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿西安交通大学材料工程专业 282分求调剂 +11 枫桥ZL 2026-03-18 13/650 2026-03-22 20:26 by edmund7
[考研] 311求调剂 +6 冬十三 2026-03-18 6/300 2026-03-22 20:18 by edmund7
[考研] 315分,诚求调剂,材料与化工085600 +3 13756423260 2026-03-22 3/150 2026-03-22 20:11 by edmund7
[考研] 289材料与化工(085600)B区求调剂 +3 这么名字咋样 2026-03-22 4/200 2026-03-22 17:56 by 云民大李老师
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 17/850 2026-03-22 15:18 by 脱颖而出
[考研] 269专硕求调剂 +6 金恩贝 2026-03-21 6/300 2026-03-22 14:31 by ColorlessPI
[考研] 广西大学材料导师推荐 +3 夏夏夏小正 2026-03-17 5/250 2026-03-21 22:20 by 金昊ML
[考研] 278求调剂 +9 烟火先于春 2026-03-17 9/450 2026-03-21 17:47 by 学员8dgXkO
[考研] 0703化学297求调剂 +3 Daisy☆ 2026-03-20 3/150 2026-03-21 17:45 by ColorlessPI
[考研] 求调剂 +3 白QF 2026-03-21 3/150 2026-03-21 13:12 by zhukairuo
[考研] 307求调剂 +3 wyyyqx 2026-03-17 3/150 2026-03-21 03:20 by JourneyLucky
[考研] 324分 085600材料化工求调剂 +4 llllkkkhh 2026-03-18 4/200 2026-03-21 01:24 by JourneyLucky
[考研] 294求调剂材料与化工专硕 +15 陌の森林 2026-03-18 15/750 2026-03-20 23:28 by JourneyLucky
[考研] 288求调剂 +16 于海海海海 2026-03-19 16/800 2026-03-20 22:28 by JourneyLucky
[考研] 材料学硕297已过四六级求调剂推荐 +11 adaie 2026-03-19 11/550 2026-03-20 21:30 by laoshidan
[考研] 广西大学家禽遗传育种课题组2026年硕士招生(接收计算机专业调剂) +3 123阿标 2026-03-17 3/150 2026-03-20 15:58 by 飞行琦
[考研] 材料学硕318求调剂 +5 February_Feb 2026-03-19 5/250 2026-03-19 23:51 by 23Postgrad
[考研] 材料与化工求调剂 +7 为学666 2026-03-16 7/350 2026-03-19 14:48 by 尽舜尧1
[考研] 0703化学调剂 +5 pupcoco 2026-03-17 8/400 2026-03-19 13:58 by houyaoxu
[考研] 0854可跨调剂,一作一项核心论文五项专利,省、国级证书40+数一英一287 +8 小李0854 2026-03-16 8/400 2026-03-18 14:35 by 搏击518
信息提示
请填处理意见