应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 想问一下甲基化的研究和基因表达的研究有什么不同
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
81/1返回列表
查看: 981  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

ning145301

金虫 (正式写手)

[求助] 想问一下甲基化的研究和基因表达的研究有什么不同

甲基化的研究是识别不同样本间的差异甲基化区域，基因表达的研究也是识别不同样本间的差异表达基因，这二者有什么本质的不同吗？研究基因表达的方法能否直接用到甲基化数据的研究中呢？
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2012-11-07 18:48:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cesjf

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 谢谢分享经验 2012-11-09 08:19:06
一般来说，甲基化会抑制基因表达，但这需要具体问题具体分析。如果都是基于芯片的数据，研究基因表达的方法当然可以用到甲基化数据上。现在也有基于测序的基因表达(RNA-Seq)和甲基化(比如Bisulfite sequencing)数据。
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

ning145301
2楼2012-11-08 02:18:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ning145301

金虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by cesjf at 2012-11-08 02:18:29
一般来说，甲基化会抑制基因表达，但这需要具体问题具体分析。如果都是基于芯片的数据，研究基因表达的方法当然可以用到甲基化数据上。现在也有基于测序的基因表达(RNA-Seq)和甲基化(比如Bisulfite sequencing)数据 ...

谢谢，我还是有点迷茫，既然方法可以用，那对于做方法的人来说，好像研究甲基化就没有意义了
赞一下 回复此楼
3楼2012-11-08 08:42:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cesjf

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

个人感觉基于芯片的甲基化数据方法分析可能没有多大意义了。但基于测序的甲基化数据方面应该还是可以继续做下去的。
赞一下 回复此楼
4楼2012-11-08 23:36:04
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ning145301

金虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cesjf at 2012-11-08 23:36:04
个人感觉基于芯片的甲基化数据方法分析可能没有多大意义了。但基于测序的甲基化数据方面应该还是可以继续做下去的。

基于测序的甲基化数据可以在公共数据库上下载吗？我刚开始接触这一块，还望高手能指点一二，
赞一下 回复此楼
5楼2012-11-09 08:42:53
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

竹子小小

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
基因的表达不表达又不光是甲基化控制。研究甲基化不过是研究基因表达的其中一种机制。你当小分子RNA和其它各种酶不存在么。你只研究甲基化一方面也是可以的。
赞一下 回复此楼
6楼2012-11-09 10:42:20
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ning145301

金虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cesjf at 2012-11-08 02:18:29
一般来说，甲基化会抑制基因表达，但这需要具体问题具体分析。如果都是基于芯片的数据，研究基因表达的方法当然可以用到甲基化数据上。现在也有基于测序的基因表达(RNA-Seq)和甲基化(比如Bisulfite sequencing)数据 ...

我还想问一下，基于测序的甲基化数据的格式是怎样的？
基于芯片数据的，是每个CpG位点对应一个甲基化水平，那么基于测序的数据是什么样的呢？谢谢
赞一下 回复此楼
7楼2012-11-09 11:00:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cesjf

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ning145301: 金币+10, ★★★很有帮助, 谢谢你 2012-11-10 08:59:23
你可以看看Human DNA methylomes at base resolution show widespread epigenomic differences, Nature 462, 315-322 (19 November 2009)这篇文章。这是该领域经典文章（可以算是第一篇关于哺乳动物的高分辨率甲基化图谱的文章），相关数据可以在http://neomorph.salk.edu/human_methylome/index.html上下载。
赞一下(1人) 回复此楼
8楼2012-11-10 00:15:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ning145301 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 289求调剂 +10 新时代材料 2026-03-27 10/500 2026-03-28 09:53 by 无际的草原
[考研] 286求调剂 +4 丢掉懒惰 2026-03-27 7/350 2026-03-28 08:07 by baoball
[考研] 331环境科学与工程求调剂 +3 熠然好运气 2026-03-27 3/150 2026-03-28 04:11 by fmesaito
[考研] 材料与化工（0856）304求B区调剂 +7 邱gl 2026-03-27 7/350 2026-03-27 15:27 by Joe率
[考研] 308求调剂 +7 墨墨漠 2026-03-25 7/350 2026-03-27 14:47 by 狂炫麦当当
[考研] 求调剂323材料与化工 +7 1124361 2026-03-24 7/350 2026-03-27 10:22 by wangjy2002
[考研] 求调剂，一志愿 南京航空航天大学大学 ，080500材料科学与工程学硕 +4 @taotao 2026-03-26 5/250 2026-03-27 08:10 by hypershenger
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +3 崔wj 2026-03-26 3/150 2026-03-27 07:58 by chemisry
[考研] 一志愿武汉理工，总分321，英一数二，求老师收留。 +5 nnnnnnn5 2026-03-25 5/250 2026-03-27 04:42 by wxiongid
[考研] 调剂求收留 +7 果然有我 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:26 by wxiongid
[考研] 341求调剂 +7 青柠檬1 2026-03-26 7/350 2026-03-27 00:19 by wxiongid
[考研] 325求调剂 +3 Aoyijiang 2026-03-23 3/150 2026-03-26 20:46 by 不吃魚的貓
[考研] 329求调剂 +5 1() 2026-03-22 5/250 2026-03-26 20:40 by fmesaito
[考研] 085600 材料与化工 329分求调剂 +9 Mr. Z 2026-03-25 9/450 2026-03-26 10:36 by baoball
[考研] 求调剂 +3 QiMing7 2026-03-25 3/150 2026-03-25 21:13 by 给你你注意休息
[考研] 293求调剂 +7 加一一九 2026-03-24 7/350 2026-03-25 12:02 by userper
[考研] 化工专硕求调剂 +3 question挽风 2026-03-24 3/150 2026-03-24 18:48 by jhhcooi
[考研] 300求调剂，材料科学英一数二 +5 leaflight 2026-03-24 5/250 2026-03-24 16:25 by laoshidan
[考研] 305分求调剂（食品工程） +5 Sxy112 2026-03-21 7/350 2026-03-24 12:27 by 544594351
[考研] 材料学硕301分求调剂 +7 Liyouyumairs 2026-03-21 7/350 2026-03-21 22:31 by peike
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭