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bayu18

新虫 (正式写手)

[求助] 克隆基因

我现在想在一种植物中克隆某一个基因,但在这种植物中这个基因是一无所知的,只知道其他物种中该基因的序列,我该如何克隆这个基因?谢谢!
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bayu18

新虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by hubinghello at 2012-11-04 12:39:20
如果其他物种上报道过相关基因,就可以进行同源克隆。找一些相近物种的此基因序列,进行比对,在保守区设计兼并引物,以你的模板跑PCR,克隆出来片段,再扩全长。
至于其他物种的序列,看看跟你做相同基因的文章, ...

因为不知道这种植物该基因的片段,那如何判断亲缘关系的远近
3楼2012-11-04 13:32:32
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hubinghello

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
bayu18: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-11-04 16:31:32
amisking: 回帖置顶 2012-11-04 18:15:30
xy656691: 金币+5, 应助指数+1, 很好 2013-04-08 20:43:09
如果其他物种上报道过相关基因,就可以进行同源克隆。找一些相近物种的此基因序列,进行比对,在保守区设计兼并引物,以你的模板跑PCR,克隆出来片段,再扩全长。
至于其他物种的序列,看看跟你做相同基因的文章,同样是用同源克隆的话,文章中肯定是会列出参考序列登录号的,就可以去NCBI上copy一下就可以了;也可以去NCBI上直接搜基因名字。
去爱吧,像不曾爱过一样;跳舞吧,像没有人观看一样;唱歌吧,像没有人聆听一样;生活吧,像每天都是世界末日一样;赚钱吧,像不是为了钱一样。
2楼2012-11-04 12:39:20
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hubinghello

金虫 (小有名气)

引用回帖:
3楼: Originally posted by bayu18 at 2012-11-04 13:32:32
因为不知道这种植物该基因的片段,那如何判断亲缘关系的远近...

亲缘关系这个。。。理论知识咯,单子叶啊 双子叶啊,木本啊 草本啊,同一个科同一个属啊,越相似就越近咯。
去爱吧,像不曾爱过一样;跳舞吧,像没有人观看一样;唱歌吧,像没有人聆听一样;生活吧,像每天都是世界末日一样;赚钱吧,像不是为了钱一样。
4楼2012-11-05 15:18:00
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bayu18

新虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by hubinghello at 2012-11-05 15:18:00
亲缘关系这个。。。理论知识咯,单子叶啊 双子叶啊,木本啊 草本啊,同一个科同一个属啊,越相似就越近咯。...

我感觉植物分类学上的那个亲缘关系在这里可能用不上,分类学上关系较近,可能它们的某些基因序列比对相差就比较大。不过,我可以试试,谢谢!
5楼2012-11-06 12:38:50
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