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构建载体测序,老在引物区段发生相同的错误,模版有突变?
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btx362237729
金虫
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虫号: 1069351
[交流]
构建载体测序,老在引物区段发生相同的错误,模版有突变?
让师弟做一个构建,引物是我设计的,并且这个反向引物以前用来做过两个构建,测序完全正确的(这点非常重要)!!!
PS:这个引物被我拿来通用做了几个构建,因为选择的质粒载体和酶切位点都没变,只是正向引物修改了。
目前的问题是,师弟拿这个反向引物做构建,测序发现老是在反向引物那一段,每次测序相同的位点反生了两个突变!!!
引物区段上怎么可能突变啊!!!不可能是引物错了,因为之前用这个反向引物测序都是正确的!!!
然后师弟再做了一次,三个单菌落,测序结果一样,还是反向引物那里错了!
我都凌乱了!!!我只能说是模版突变了!(模版是实验室传了一年半多的菌,提的质粒)!!难道真的突变了两个位点?
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2012-11-02 00:23:53
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btx362237729
金虫
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引用回帖:
10楼
:
Originally posted by
cicelyzh
at 2012-11-02 12:43:24
定引物的时候如果不要求过柱纯化的话公司只是做脱盐处理。有可能是合成的引物不是全长甚至错误的可能。因为HPLC或者RPC纯化的引物比较贵,做一般PCR大家都不选这个服务。可能你的引物不纯,有错误。据我的经验,从 ...
但是这个引物以前真的用过。。。都用来做了两个构建了 完全是正确的、、而且也不是新合成的,是以前冻存的
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11楼
2012-11-02 13:13:48
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cicelyzh
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★
btx362237729(金币+1): 谢谢参与
即使模板突变了,P出来的东西应该是和引物序列一致的。因为模板的浓度很低,合成出来的DNA大量扩增都应该是引物序列。我怀疑你的引物错了,需要把引物测序鉴定一下。
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3楼
2012-11-02 07:12:35
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竹子小小
木虫
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★
btx362237729(金币+1): 谢谢参与
看看测序图的峰是不是重叠的。可能是测序问题。
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4楼
2012-11-02 08:39:16
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yasmineross
铁虫
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★ ★ ★
btx362237729(金币+1): 谢谢参与
小丹木木: 金币+2, 鼓励交流
2012-11-02 13:58:18
如果测序结果没有问题的话,就是引物的质量问题了。
LZ一直说引物以前用过,是以前用过这个引物序列,还是一直用的同一支引物?
如果是根据老序列新合成的引物,那就是引物序列上有突变吧。
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5楼
2012-11-02 09:13:39
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