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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » DS/Sybyl/Autodock » ！！重金悬赏！！只要解决问题，200金币送你了！！
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alex2000

金虫 (小有名气)

[求助] ！！重金悬赏！！只要解决问题，200金币送你了！！

最近有机会上大型机，所以下了个Accelrys.Discovery.Studio.v2.5.Linux.ISO，试着安装，但遇到很大问题。
这个版本的DS我曾经在个人机（red hat Linux enterprise 4 ）上安装成功过，所以软件本身没有问题，license绝对可用。这台大型机的系统是red hat Linux enterprise 5 UP7，由数百个CPU组装。我主要在PipelinePilot安装时出错。一开始指定安装目录、指定license目录都没有问题，正常安装，跟个人机上一样
1.JPG

2.JPG

但装到gene express 后不知什么地方就出错了，它翻得太快看不清，具体信息如下。我所知道的是个人机上已经装成功过，因此应该不是license的问题。且我已经在root下装过sciseallow，但还是不行。


3.JPG

4.JPG

请大家帮忙，解决问题者重赏200金币，绝不拖欠！！非常感谢！！
另外，我考虑是不是因为该版本有可能是X86的，而不是X64的，所以与该大型机的64位CPU不适合？不过，一开始安装的很顺利啊，应该不会装到一半出错了吧。

[ Last edited by alex2000 on 2012-10-31 at 09:31 ]
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1楼 2012-10-31 09:19:04
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jewelseeker

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ...
zh1987hs: 金币+50, 楼主悬赏 2012-11-02 11:02:38
zh1987hs: 金币+50, 楼主悬赏 2012-11-02 11:02:58
Discovery Studio对软件系统要求比较严格，DS2.5支持的Linux版本如下：
x86 (32-bit)
Red Hat® Enterprise Linux® 4.0, Updates 4-7
x86-64 (64-bit)
Red Hat Enterprise Linux 4.0, Updates 4-7
Red Hat Enterprise Linux 5, Retail, Updates 1-2
个人曾经在Red Hat Enterprise Linux 5, Retail, Updates4 上安装成功过（http://jewelseeker.blog.163.com/ ... 709320121181627366/）但更新的版本应该是不行的。

此外，请确认一下该大型机是安装的red hat Linux enterprise 5 UP7有无安装X11，DS是需要有X11支持的，如：Genome。
所以可能有两个原因：1、RHEL5.7对DS2.5来说，版本太新；2、系统没有安装Genome。
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人生是一种修行！
2楼2012-11-01 15:58:07
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alex2000

金虫 (小有名气)
请问X11是这个吗

xorg-x11-server-Xvfb (x86_64)*
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3楼2012-11-01 17:19:25
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jewelseeker

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与，应助指数 +1
确定是否安装x11，可以看一下你的server是图形界面还是字符界面啊。因为一般大型机都是安装纯文本界面的RHEL。
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人生是一种修行！
4楼2012-11-01 17:24:26
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jewelseeker

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
jiaoyixiong: 金币+10, 赞 2012-11-02 14:07:20
把之前我的安装过程贴给你，如果你确认是RHEL5 x86_64的话，应该可以正常安装。如果不行，则考虑是你的DS2.5不支持64位系统。

操作系统：Red Hat Enterprise Linux Server release 5.4
硬件系统：Dell T7500 Workstation
安装：
1、关闭系统防火墙和SELinux，以非root权限登录
2、放入安装光盘或是ISO镜像
    $ mount /dev/dvd /mnt/dvd
    $ cd /mnt/dvd
    $ ls
    $  ./ds_setup_linux.sh
3、按照安装指南进行完全安装（Custom或是Complete模式）。由于是cracted版本，所以安装路径全部使用默认。
4、安装Liscense
     1）将破解文件夹下的accelrys_25.lic拷贝至/home/pham_lab/Accelrys/LicensePack/Licenses/
     2）选中Configure Licensing
     3）在弹出的License Administrator对话框中，选择License File／install license
     4）点击Browse，选中accelrys_25.lic，intall license。
     5）测试License：Diagnostics／License test，如结果出现Checkout succeeded，则安装成功。

运行：
注意，需要在运行DS client 前运行PP server。特编写以下代码，命名为startDS2.5.sh
      #!/bin/sh
      cd $HOME
      Accelrys/PipelinePilot/linux_bin/startserver
      Accelrys/DiscoveryStudio25/bin/DiscoveryStudio25

登录后在终端中运行：
      $ ./sartDS2.5.sh ＆
需要注意的是，PP Server运行一次即可，在不重启机器的前提下，再次启动DS Client只需要点击桌面快捷方式，或是运行Accelrys/DiscoveryStudio25/bin文件夹下的DiscoveryStudio25
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5楼2012-11-01 18:10:10
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