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smartcheng铁虫 (小有名气)
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castep中限制原子只沿某个方向运动
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我看前人的帖子说，只有修改.cell 文件，才能做到按方向性限制。如下所示，如果要限制第二个Al原子不能沿着X方向移动 4 Al 2 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 5 Al 2 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 这样怎么会达到限制x方向的目的，这里面的1和0都代表什么啊。 原帖： Q3：如何在CASTEP计算中限制某个原子的移动方向？ A3：CASTEP计算中只支持Fraction坐标，不支持Coordinate坐标。采用常规方式无法限制原子的移动方向，需要手动修改CASTEP的Cell文件，具体方式如下，在 %BLOCK POSITIONS_FRAC Al 0.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 Al 0.2270171283 0.2094837802 0.5009850469 Al 0.5000000000 0.0000000000 0.5000000000 Al 0.5000000000 0.5000000000 0.0000000000 %ENDBLOCK POSITIONS_FRAC 中包括每个原子的分数坐标，请留意每个原子的编号，在下面的计算中会有所帮助。 在Cell文件中，关于原子坐标限制的部分如下： FIX_COM : false %BLOCK IONIC_CONSTRAINTS 1 Al 1 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 2 Al 1 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 3 Al 1 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 4 Al 3 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 5 Al 3 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 6 Al 3 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 7 Al 4 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 8 Al 4 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 9 Al 4 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 %ENDBLOCK IONIC_CONSTRAINTS 其中包括每行编号（紫色），原子类型（红色），原子编号（绿色）和需要限制的分数坐标（黑色）。如果要限制第二个Al原子不能沿着X方向移动，那么在该部分的设置如下： 1 Al 1 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 2 Al 1 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 3 Al 1 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 4 Al 2 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 5 Al 2 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 6 Al 3 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 7 Al 3 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 8 Al 3 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 9 Al 4 1.0000000000 0.0000000000 0.0000000000 10 Al 4 0.0000000000 1.0000000000 0.0000000000 11 Al 4 0.0000000000 0.0000000000 1.0000000000 注意，编号要顺次后移，否则会出错，黑色部分分别对应于x、y、z三个方向，完成后，使用Run Files方式即可进行计算。 此外，在 %BLOCK CELL_CONSTRAINTS 1 2 3 4 5 6 %ENDBLOCK CELL_CONSTRAINTS 中可以限制晶胞向量的变化，第一行分别表示三个晶胞参数a、b、c， 第二行表示晶胞角度α、β、γ。上述结构表明参数可以被优化，如果需要加以限制，则需要改为0。 |
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