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高斯输出文件转化为mol2文件时出现问题 -c resp 与 -c bcc
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将高斯输出文件转化为mol2文件时，使用命令如下 antechamber -i a.log -fi gout -o a.mol2 -fo mol2 -c resp 得到错误提示 unit 10 Error on open: ANTECHAMBER.ESP unit 3 Error on open:qout cannot open charge file to read:QOUT ,exit 而使用-c bcc时候就没有错误提示。请问这是什么原因导致的。两种方法分别适合什么时候用呢 |
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 amber |
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wangyan10
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【答案】应助回帖
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感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-10-30 08:54:55
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-10-30 08:54:55
| -c后面的bcc和resp是两种不同的charge model。resp采用的方法是HF，而bcc采用AM1方法，这两者是不同的。http://ambermd.org/tutorials/adv ... resp_paper_jacs.pdf 这是一篇介绍resp charge model的原始文献，想了解的话可以看一下。至于哪种charge model适用于什么样的体系，自己做科研去领悟吧！这个不是一会半会能说明白的问题。 |
2楼2012-10-29 20:03:15
lujunyan1118
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3楼2012-10-29 20:05:05
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高斯输入文件不是antechamber 生成的，用gassianview生成的.gif文件。自己修改部分后，内容如下 %chk=egcg.chk %nprocshared=8 %mem=8000MB # opt freq rb3lyp/6-31g egcg.mol2 0 1 C 0.18226000 1.41376000 -0.12743000 C 1.37057000 2.14000000 0.07324000请问：如果用antechamber生成.gjf的话，生成之后还需要修改哪里（就是你说的关键词是哪个，难道改rb3lyp为HF吗）才能保证-resp这个命令能成功运行。 |
4楼2012-10-30 17:26:13
lujunyan1118
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5楼2012-10-30 19:51:42
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