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woshiap

铁虫 (初入文坛)

[求助] 请教各位前辈关于EMSA(gel shift)的问题! 已有1人参与

我没做过蛋白实验,理论知识也懂的少,书上面的东西自己不敢确定是不是理解的对。所以想各位前辈求教!我准备做EMSA实验,验证C/EBPβ跟我做的基因启动子核心区域的结合。超标达我做了,结果很好。所遇到的问题如下:1.我看有promega的gel shift试剂盒和thermo的EMSA试剂盒,前者便宜一半,但是不知道哪个跟好些?
2.我用在线软件TFsearch在我验证的核心启动子去找到2个C/EBPβ。但是预测的结果显示,2个C/EBPβ 的结合位点的序列不同,这样的话,我合成探针是不是要合成2个,还是合成一个但包含2个2个C/EBPβ不同的结合序列?是不是探针一定要p32标记?标两端吗?
3.我是做猪的基因,抗体的话猪的很少!C/EBPβ只在santa cruz 这家找到一个可以在猪上用的。不知道怎么才能验证这个抗体是否符合要求?
希望各位能为小弟解答迷津!在此谢过!
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yuxiangrousi

铜虫 (初入文坛)

想问下你的转录因子是怎么找出来的啊??  我最近也在找 用酵母单杂的方法 但是还没有成功``
需要多多吸取知识
5楼2012-12-10 13:52:14
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查看全部 7 个回答

weigh1111

铁杆木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-10-24 13:48:33
1.我没用过试剂盒,但是这两家的试剂盒应该都还不错吧~
2.最好分成两个合成吧~而且P32标记的时候我们采用的是标记引物然后PCR扩增最后回收的方法,是标记的一头。但是实际上也有人PCR扩增出来之后再用P32标记,这样的话就是标记的两头。而且如果你单纯只是看结合不结合的话可以考虑做不用标记的DNA来实验,最后用sybr green或者EB染胶
3.话说你EMSA的话,抗体准备拿来做什么呢?western?
3楼2012-10-24 08:59:52
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woshiap

铁虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by weigh1111 at 2012-10-24 08:59:52
1.我没用过试剂盒,但是这两家的试剂盒应该都还不错吧~
2.最好分成两个合成吧~而且P32标记的时候我们采用的是标记引物然后PCR扩增最后回收的方法,是标记的一头。但是实际上也有人PCR扩增出来之后再用P32标记,这样 ...

谢谢你的回复!抗体是用来定性检测转录因子的!
4楼2012-10-25 08:53:23
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huangqi2016

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by weigh1111 at 2012-10-24 08:59:52
1.我没用过试剂盒,但是这两家的试剂盒应该都还不错吧~
2.最好分成两个合成吧~而且P32标记的时候我们采用的是标记引物然后PCR扩增最后回收的方法,是标记的一头。但是实际上也有人PCR扩增出来之后再用P32标记,这样 ...

你好!请问EB染胶能看到标记上了生物素吗?

发自小木虫IOS客户端
6楼2016-03-13 11:10:32
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