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xingyanfei金虫 (正式写手)
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[求助]
用SMD求PMF如何求？
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用smd求pmf如何求，我看了教程，没看懂smd.tcl文件！！！！ 1.需要用smd模拟多次，是如何实施的？ 2.原子时如何选择的？smd.tcl中写的如下，看不懂是如何选择的！！ # Atoms selected for force application set id1 [atomid BH 1 N] set grp1 {} lappend grp1 $id1 set a1 [addgroup $grp1] set id2 [atomid BH 10 NT] set grp2 {} lappend grp2 $id2 set a2 [addgroup $grp2] # set the output frequency, initialize the time counter set Tclfreq 50 set t 0 |
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