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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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xingyanfei

金虫 (正式写手)

[求助] 用SMD求PMF如何求?

用smd求pmf如何求,我看了教程,没看懂smd.tcl文件!!!!
1.需要用smd模拟多次,是如何实施的?
2.原子时如何选择的?smd.tcl中写的如下,看不懂是如何选择的!!
# Atoms selected for force application

set id1 [atomid BH 1 N]
set grp1 {}
lappend grp1 $id1
set a1 [addgroup $grp1]

set id2 [atomid BH 10 NT]
set grp2 {}
lappend grp2 $id2
set a2 [addgroup $grp2]

# set the output frequency, initialize the time counter
set Tclfreq 50
set t 0
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niuyuzhen110

新虫 (初入文坛)

送红花一朵
请问你这个问题解决了吗?我也想知道啊
2楼2014-03-31 14:58:16
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xingyanfei

金虫 (正式写手)


月只蓝: 金币+1, 感谢分享心得! 2014-04-08 18:49:59
引用回帖:
2楼: Originally posted by niuyuzhen110 at 2014-03-31 14:58:16
请问你这个问题解决了吗?我也想知道啊

我也没有搞懂,
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3楼2014-04-08 09:36:12
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