| 查看: 1110 | 回复: 2 | ||
xingyanfei金虫 (正式写手)
|
[求助]
用SMD求PMF如何求？
|
|
用smd求pmf如何求，我看了教程，没看懂smd.tcl文件！！！！ 1.需要用smd模拟多次，是如何实施的？ 2.原子时如何选择的？smd.tcl中写的如下，看不懂是如何选择的！！ # Atoms selected for force application set id1 [atomid BH 1 N] set grp1 {} lappend grp1 $id1 set a1 [addgroup $grp1] set id2 [atomid BH 10 NT] set grp2 {} lappend grp2 $id2 set a2 [addgroup $grp2] # set the output frequency, initialize the time counter set Tclfreq 50 set t 0 |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
niuyuzhen110» 猜你喜欢
让我中一个面上吧！
已经有5人回复
-
科研孤儿太难了
已经有12人回复
-
言之凿凿，明天官网会通知放榜？
已经有17人回复
-
时间戳又变了
已经有17人回复
-
今天系统多次维护，明天很可能放榜！
已经有11人回复
-
时间戳变了，能看出什么问题？
已经有23人回复
-
只有每年这种时候来逛逛小木虫
已经有22人回复
-
放榜前的不淡定
已经有12人回复
-
重要消息，中午系统在维护
已经有12人回复
-
今天基金会出结果吗？20260819
已经有15人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 【求助】请教如何使用GROMACS做PMF？
已经有8人回复
- 【求助/交流】哪位虫友有pPICZaA 载体和SMD1168或GS115菌株
已经有5人回复
- 【求助/交流】求SMD1168摇瓶及上罐发酵的详细操作
已经有4人回复
niuyuzhen110
新虫 (初入文坛)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 216.5
- 散金: 100
- 帖子: 37
- 在线: 51.3小时
- 虫号: 1885229
- 注册: 2012-07-09
- 专业: 化学计量学与化学信息学
2楼2014-03-31 14:58:16
xingyanfei
金虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1897.7
- 红花: 2
- 帖子: 761
- 在线: 265.3小时
- 虫号: 1504011
- 注册: 2011-11-22
- 性别: MM
- 专业: 原子和分子物理
3楼2014-04-08 09:36:12
40