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杨寻铁杆木虫 (著名写手)
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实在不知道siesta如何开始运行，折腾了好几天 能尝试的都试了。
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在我的/siesta目录下建立fe.fdf 和fe. psf 这两个文件。然后还有个脚本。总共三个文件，但是就是不能运行，一直处于排队状态，不是服务器的问题，换成gaussian和vasp都能立即运行，而且排队两天都不能计算。所以敢问大家： 是不是运行siesta只需要输入文件fe.fdf和赝势文件fe.psf? 还是我的脚本写的有问题？实在是找不出原因。 希望高手指条明路，非常感谢。 写脚本如下： #PBS -N siesta #PBS -l nodes=1:ppn=8 #PBS -j oe #PBS -l walltime=1000:00:00 cd $PBS_O_WORKDIR source /opt/intel/Compiler/11.1/072/bin/iccvars.sh intel64 source /opt/intel/Compiler/11.1/072/bin/ifortvars.sh intel64 source /opt/intel/impi/4.0.0.028/bin64/mpivars.sh source /opt/intel/impi/4.0.0/bin/mpivars.sh source /opt/intel/impi/4.0.0/ia32/bin/mpivars.sh source /opt/intel/Compiler/11.1/072/mkl/tools/environment/mklvarsem64t.sh source /opt/intel/Compiler/11.1/072/mkl/tools/environment/mklvars64.sh source /opt/intel/Compiler/11.1/072/mkl/tools/environment/mklvars32.sh source /opt/intel/mkl/10.2.5.035/tools/environment/mklvars32.sh source /opt/intel/mkl/10.2.5.035/tools/environment/mklvars64.sh source /opt/intel/mkl/10.2.5.035/tools/environment/mklvarsem64t.sh source /opt/intel/mpi-rt/4.0.0/bin/mpivars.sh source /opt/intel/mpi-rt/4.0.0/bin/compchk.sh source /opt/intel/mpi-rt/4.0.0/bin64/compchk.sh source /opt/intel/mpi-rt/4.0.0/bin64/mpivars.sh source /opt/intel/cmkl/10.2.5.035/tools/environment/mklvars32.sh source /opt/intel/cmkl/10.2.5.035/tools/environment/mklvars64.sh source /opt/intel/cmkl/10.2.5.035/tools/environment/mklvarsem64t.sh NP=`cat $PBS_NODEFILE|wc -l` mpirun -machinefile $PBS_NODEFILE -np $NP \ /opt/software/siesta-3.0-b/Src/siesta <$fe.fdf >& $fe.out |
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