| 查看: 2669 | 回复: 8 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
[求助]
用SMD算溶剂下单点能，自由能应该用哪个
|
||
|
我使用的是Gaussian 09，我在气相做了opt freq之后，取了优化后的结构（最后一个）做了溶剂中的单点能计算 输入文件我这样写的 %chk=smd-eigth.chk %mem=1200mb %nprocshared=8 #p b3lyp/gen scrf(solvent=1,4-dioxane,smd,dovacuum,externaliteration) nosymm Title Card Required 算完之后高斯的.log文件里能量有好几个，我该取哪个，然后和气相里的哪个数据加减，得到溶剂下的Gibbs自由能呢 以下是算溶剂下单点能的.log文件里的，我摘了几段 SCF Done: E(RB3LYP) = -756.550033126 A.U. after 14 cycles Convg = 0.5789D-08 -V/T = 2.0036 KE= 7.538468931103D+02 PE=-3.324979693767D+03 EE= 1.038308897138D+03 Leave Link 502 at Mon Oct 15 11:32:28 2012, MaxMem= 157286400 cpu: 589.7 (Enter /public1/Gauss09.A02/g09/l601.exe) (Enter /public1/Gauss09.A02/g09/l124.exe) SC-PCM: Using the SCF density. SC-PCM: The equilibrium contribution to the free energy is -0.005315010 a.u. SC-PCM: The total energy including the PCM contribution is -756.555051050 a.u. SC-PCM: Erms= 0.14603D-07 Emax= 0.60232D-07 Qconv= 0.10000D-06 SC-PCM: Convergence achieved in 5 iterations. SC-PCM: The reaction field is now self-consistent. Error on total polarization charges = 0.03473 -------------------------------------------------------------------- Self-consistent PCM results =========================== Total free energy in solution: - with all non electrostatic terms (a.u.) = -756.554983 -------------------------------------------------------------------- (Unpolarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -2.98 (Polarized solute)-Solvent (kcal/mol) = -3.34 Solute polarization (kcal/mol) = 0.19 Total electrostatic (kcal/mol) = -3.15 -------------------------------------------------------------------- SMD-CDS (non-electrostatic) energy (kcal/mol) = 0.04 (included in total energy above) Total non electrostatic (kcal/mol) = 0.04 DeltaG (solv) (kcal/mol) = -3.11 -------------------------------------------------------------------- Dipole moment (Debye): in vacuo : X= 0.5513 Y= 0.1401 Z= 0.0640 Tot= 0.5724 in solution : X= 0.6048 Y= 0.1194 Z= 0.0748 Tot= 0.6210 --------------------------------------------------------------------  帮帮忙吧 |
回复此楼» 本帖已获得的红花（最新10朵）
taylorwang» 猜你喜欢
高效微纳米储能材料与产业化推进实验室 苏州 招收硕士研究生（含调剂）
已经有5人回复
-
高效微纳米储能材料与产业化推进实验室 苏州 招收硕士研究生（含调剂）
已经有0人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有214人回复
-
高效微纳米储能材料与产业化推进实验室 苏州 招收硕士研究生（含调剂）
已经有2人回复
-
研究生招生
已经有0人回复
-
化学化工学院 招收化工、化学、材料等相关方向研究生（学硕、专硕都有调剂名额）
已经有1人回复
-
高效微纳米储能材料与产业化推进实验室 苏州 招收硕士研究生（含调剂）
已经有0人回复
-
温州大学新能源材料微观溯源课题组招收2026级博士研究生（材料、化学方向）
已经有6人回复
-
材料与化工 323 英一+数二+物化，一志愿：哈工大 本人本科双一流
已经有5人回复
-
26申博
已经有2人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 【求助】溶剂化效应自由能的输出问题
已经有10人回复
- 【求助】请教用高斯09算溶剂化单点时，怎样得到溶剂中的Gibbs自由能？
已经有9人回复
liweiyi123456
铁杆木虫 (职业作家)
- 应助: 18 (小学生)
- 金币: 26404.2
- 散金: 4080
- 红花: 7
- 帖子: 4286
- 在线: 469.2小时
- 虫号: 467835
- 注册: 2007-11-27
- 专业: 理论和计算化学
5楼2012-10-21 18:02:21
感谢参与，应助指数 +1
|
本帖内容被屏蔽 |
2楼2012-10-18 16:32:04
|
气相里我只是做了opt和freq .log文件里有 SCF Done: E(RB3LYP) = -756.550033010 A.U. after 9 cycles Convg = 0.5311D-08 -V/T = 2.0036 KE= 7.538467221087D+02 PE=-3.324966663974D+03 EE= 1.038302468960D+03 Rotational temperatures (Kelvin) 0.06798 0.01256 0.01246 Rotational constants (GHZ): 1.41645 0.26171 0.25964 Zero-point vibrational energy 629099.4 (Joules/Mol) 150.35837 (Kcal/Mol) Zero-point correction= 0.239611 (Hartree/Particle) Thermal correction to Energy= 0.255306 Thermal correction to Enthalpy= 0.256250 Thermal correction to Gibbs Free Energy= 0.194049 Sum of electronic and zero-point Energies= -756.310422 Sum of electronic and thermal Energies= -756.294727 Sum of electronic and thermal Enthalpies= -756.293783 Sum of electronic and thermal Free Energies= -756.355984 气相里应该用哪个？是用0.194049吗？结果是-756.554983+0.194049 这样对吗？ |
3楼2012-10-19 10:39:39
emmaxue
木虫 (正式写手)
- 应助: 10 (幼儿园)
- 金币: 2919.8
- 红花: 4
- 帖子: 857
- 在线: 238.6小时
- 虫号: 1249923
- 注册: 2011-03-30
- 性别: MM
- 专业: 应用高分子化学与物理
4楼2012-10-19 15:37:35
