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细菌16S rDNA焦磷酸测序会不会产生真核生物信息？ 已有1人参与
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| 我的实验是用焦磷酸测序进行微生物分类鉴定。PCR扩增细菌16S rDNA V1-V3 region，8F (5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3') and 533R (5'-TTACCGCGGCTGCTGGCAC-3')。Silva106比对，Mothur分析（交给公司做的，技术员走人了）。最后的结果中，大部分序列属于细菌，但有极少量序列被分配到几个真核生物（节足动物门Arthropoda, 棘头动物门Acanthocephala，毛颚动物门Chaetognatha, 软体动物门Mollusca ）。这些门类中，Arthropoda有17条序，其他真核门类也就各1条序。真核生物的线粒体16s作为物种鉴定确实有这么个方法，但细菌16s和真核16s的引物应该不是通用的，照理来说不应该产生真核生物信息，不知怎么解释？难道仅仅是errors in taxonomic assignment? 文章在大修，求教中，万分感激！ |
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2楼2019-03-08 15:07:13