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Alyssa215木虫 (著名写手)
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[求助]
晶体加氢
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| 求各位高手帮忙给这两个数据加下氢哦，由于本人水平有限，氢原子总是加不成功，请各位解晶高手能够帮帮忙，最好能帮我把这两个数据精修到没有A类错误哦，谢谢！ |
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2012-10-16 19:47:11, 5.15 M
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lijunjie84: 金币+1, 感谢应助！ 2012-10-17 17:32:47
lijunjie84: 金币+1, 感谢应助！ 2012-10-17 17:32:47
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在xp里面操作哈。 比如我要对水分子O1进行加氢。如果直接用hadd O1是不行的。要先按合理的氢键构型将O1的加氢位置做一定的限定。比如和旁边的O2和O3先连起来。命令式link O1 O2和link O1 O3。 这时候O1就只剩下两个位置可以加氢了，再来hadd O1 2，加成二级碳上的氢。 再看看是不是就加好了。记得undo O1 O3和undo O1 O2。 保存，退出xp。edit 123.ins。 找到刚才给O1加上的两个氢。它们的前面有afix命令。应该是afix 23。把这个afix 23改成afix 3。这样再xl就不会出错了。 试试吧。 |
6楼2012-10-17 16:43:26
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
Alyssa215: 金币+5, ★有帮助, 能不能麻烦你帮我加下哦，我在加氢这方面实在是不行，由于我论文马上就要交了，很着急了，请你帮帮忙哦，谢谢啦！ 2012-10-17 08:44:07
linhua0402313: 金币+1, 恩，感谢回帖交流，欢迎常来晶体板块 2012-10-17 10:41:07
感谢参与，应助指数 +1
Alyssa215: 金币+5, ★有帮助, 能不能麻烦你帮我加下哦，我在加氢这方面实在是不行，由于我论文马上就要交了，很着急了，请你帮帮忙哦，谢谢啦！ 2012-10-17 08:44:07
linhua0402313: 金币+1, 恩，感谢回帖交流，欢迎常来晶体板块 2012-10-17 10:41:07
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全是水啊。。。 加起来就非常麻烦。 思路是，将你要加氢的氧原子按合理的氢键构型和旁边的原子连起来。命令是：link O? O?? 给这个氧原子留下两个空位，再执行加氢命令 hadd O? 2 这样就加上了两个氢原子。 其他的氧原子也这么做。注意在xl之前，先编辑ins文件中你刚才加上的氢的类型。把afix 23改成afix 3就行。 |
2楼2012-10-16 21:40:40
3楼2012-10-17 09:54:36
etongtong
铁杆木虫 (著名写手)
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- 红花: 6
- 帖子: 1534
- 在线: 245.5小时
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4楼2012-10-17 10:10:57
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