版块导航: 正在加载中...

客户端APP下载

登录注册

应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜

当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

shaxijiang

金虫 (小有名气)

热血男儿

应助: 0 (幼儿园)
金币: 1265.3
红花: 2
帖子: 62
在线: 168.9小时
虫号: 787661
注册: 2009-06-05
性别: GG
专业: 化工热力学和基础数据

[求助] 如何统计氢键的个数

在MS中使用动力学模拟之后，如何统计体系中氢键的个数？谢谢啊，急求！

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

» 猜你喜欢

售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急已经有6人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急已经有5人回复
售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急已经有8人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急已经有6人回复
2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战已经有4人回复
跳槽后在研项目怎么办？已经有10人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急已经有5人回复
什么时候开奖？已经有10人回复
2026国自然函评费到账已经有16人回复
售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急已经有9人回复

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

分子内氢键以何种形式存在如何做理论计算已经有6人回复
用MS计算氢键键能为什么结果为负值？已经有10人回复
求助氢键计算已经有3人回复
【求助】如何计算小分子或离子与一个二维结构材料之间的化学作用力如氢键、离子吸引？已经有16人回复
【讨论】大家讨论下计算弱键的方法-氢键，卤键已经有9人回复
【求助】什么软件可以显示和统计蛋白质中氢键已经有10人回复
【求助】怎么确定分子之间是主要氢键还是次级氢键？已经有3人回复
【讨论】关于不同z值处的水能形成氢键数的脚本讨论已经有4人回复
【求助】急！如何使用platon计算包含偏差的氢键已经有10人回复
【求助】急急：帮帮忙啊！怎样用PLATON检查氢键和计算paipai堆积啊？已经有9人回复

努力……

1楼 2012-10-09 22:32:39

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

jiaoyixiong

荣誉版主 (职业作家)

模拟EPI: 6
应助: 487 (硕士)
贵宾: 0.501
金币: 14945
散金: 6107
红花: 74
帖子: 3750
在线: 1129.1小时
虫号: 1108016
注册: 2010-09-26
性别: GG
专业: 流体力学
管辖: 分子模拟

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
shaxijiang: 金币+1, ★有帮助 2012-10-10 22:59:15

不知道你用不用VMD，
vmd命令里面有个measure hbonds

赞一下(1人)

3楼2012-10-10 13:59:33

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 7 个回答

hyzlegend

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 217.2
帖子: 71
在线: 16.8小时
虫号: 1919772
注册: 2012-08-01
性别: GG
专业: 流体力学

chaizhm: 应助指数-1, 没有应助不要点应助回帖，下次扣金币 2012-11-12 13:19:30

大神，VMD是哪一个模块？哪一个命令

4楼2012-10-23 10:09:43

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

fyz_ok

金虫 (正式写手)

应助: 11 (小学生)
金币: 620.1
红花: 5
帖子: 391
在线: 161.6小时
虫号: 288530
注册: 2006-10-21
性别: GG
专业: 聚合物共混与复合材料

VMD与MS不是同一软件，我也遇到这个问题，求解

5楼2012-10-23 10:29:37

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

猫头鹰love

新虫 (正式写手)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 558.3
散金: 44
帖子: 382
在线: 70.9小时
虫号: 1250820
注册: 2011-03-31
专业: 橡胶及弹性体

【答案】应助回帖

★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2012-11-12 13:19:44

在Build下面有一个Hydrogen bonds，打开后Monitor htdrogen bonds里打钩，然后Calculate就行了

6楼2012-11-12 10:53:11

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

查看全部 7 个回答

最具人气热帖推荐 [查看全部]		作者	回/看	最后发表

	[公派出国] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +3	2JOx3r2CYEgw 2026-08-21	6/300	2026-08-23 14:45 by KM5EcsNQRBPn
	[基金申请] 2026国自然函评费到账 +15	羊腰板 2026-08-21	16/800	2026-08-23 10:45 by process2012
	[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3	2JOx3r2CYEgw 2026-08-21	9/450	2026-08-23 10:44 by IXZuIJ2Q7OVy
	[基金申请] 让我中一个面上吧！ +12	大萍1987 2026-08-20	14/700	2026-08-23 10:30 by wrm
	[基金申请] 今天放榜吗？ +15	布布和一二 2026-08-19	16/800	2026-08-23 09:55 by 张春生
	[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3	2JOx3r2CYEgw 2026-08-22	5/250	2026-08-23 07:41 by OEbVnUOu01ol
	[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3	2JOx3r2CYEgw 2026-08-22	4/200	2026-08-23 04:04 by OEbVnUOu01ol
	[硕博家园] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3	2JOx3r2CYEgw 2026-08-22	7/350	2026-08-23 03:55 by OEbVnUOu01ol
	[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3	2JOx3r2CYEgw 2026-08-22	6/300	2026-08-23 03:40 by OEbVnUOu01ol
	[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +3	zjuhero 2026-08-22	4/200	2026-08-22 20:02 by mycsru
	[教师之家] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +4	2JOx3r2CYEgw 2026-08-21	4/200	2026-08-22 16:52 by sunzitan
	[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5	archvillain 2026-08-20	5/250	2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
	[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +16	医学老男孩 2026-08-20	20/1000	2026-08-21 21:13 by Ldrop2023
	[基金申请] 科研孤儿太难了 +17	我4大白菜 2026-08-20	18/900	2026-08-21 20:57 by zhangev
	[基金申请] 感觉是下周放榜了 +7	angus9576 2026-08-17	12/600	2026-08-21 13:38 by weiyin
	[基金申请] 我面上完蛋了 +7	且听虎啸 2026-08-20	8/400	2026-08-21 12:31 by 酷酷墨镜
	[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4	哈哈蛤？ 2026-08-21	4/200	2026-08-21 10:58 by Vivilian
	[基金申请] 时间戳变了，能看出什么问题？ +18	基诺咪客 2026-08-17	23/1150	2026-08-20 17:19 by Godzela
	[基金申请] 朋友圈看到的 +6	wangzilk 2026-08-18	8/400	2026-08-19 10:55 by Haru815
	[基金申请] 明天放榜？ +5	Shxjjxjkx 2026-08-18	5/250	2026-08-18 18:14 by -大大大大大-