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horson金虫 (小有名气)
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VASP识别对称性的能力如何？
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据说VASP对晶体的对称性识别能力不好，并且只能粗略地识别点群而非空间群，不知是否如此？ 我编辑了一个方解石的POSCAR文件，从OUTCAR文件来看VASP连点群都没有识别对。不知是不是我的理解有问题，请大伙帮我看看： POSCAR文件（附件中有源文件）： Ca C O (Hexagonal Calcite) 1.0 4.3211203770054700 -2.4948000771893200 0.0000000000000000 0.0000000000000000 4.9896000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 17.0610000000000000 6 6 18 Direct 0 0 0 0.6667 0.3333 0.3333 0.3333 0.6667 0.6667 0 0 0.5 0.6667 0.3333 0.8333 0.3333 0.6667 0.1667 0 0 0.25 0.6667 0.3333 0.5833 0.3333 0.6667 0.9167 0 0 0.75 0.6667 0.3333 0.0833 0.3333 0.6667 0.4167 0.2768 0 0.25 0 0.2768 0.25 0.7232 0.7232 0.25 0.6667 0.6101 0.5833 0.0565 0.3898 0.9167 0.3899 0.0565 0.5833 0.6101 0.6667 0.9167 0.9435 0.3333 0.5833 0.3333 0.9435 0.9167 0.2768 0.2768 0.75 0 0.7232 0.75 0.7232 0 0.75 0.6667 0.0565 0.0833 0.0565 0.6667 0.4167 0.3899 0.3333 0.0833 0.6101 0.9435 0.4167 0.9435 0.6101 0.0833 0.3333 0.3899 0.4167 OUTCAR的相关输出： LATTYP: Found a hexagonal cell. ALAT = 4.9895999807 C/A-ratio = 3.4193121825 Lattice vectors: A1 = ( 4.3211203770, -2.4948000772, 0.0000000000) A2 = ( 0.0000000000, 4.9896000000, 0.0000000000) A3 = ( 0.0000000000, 0.0000000000, 17.0610000000) Subroutine PRICEL returns: Original cell was already a primitive cell. Analysis of symmetry for initial positions (statically): Routine SETGRP: Setting up the symmetry group for a hexagonal supercell. Subroutine GETGRP returns: Found 1 space group operations (whereof 1 operations were pure point group operations) out of a pool of 24 trial point group operations. The static configuration has the point symmetry C_1 . Analysis of symmetry for dynamics (positions and initial velocities): Subroutine DYNSYM returns: Found 1 space group operations (whereof 1 operations were pure point group operations) out of a pool of 1 trial space group operations (whereof 1 operations were pure point group operations) and found also 1 'primitive' translations The dynamic configuration has the point symmetry C_1 . |
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2012-10-09 21:55:09, 1.14 K
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5楼2012-10-11 10:30:00
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"VASP includes a full featured symmetry code which determines the symmetry of arbitrary configurations automatically." 应该来说，其识别能力还是很强的。 问题在0.3333和0.6667上，至少精确到6位。如0.333333、0.666667这样才能识别出1/3和2/3。 VASP中实际上是由SYMPREC这个参数来控制的，默认值10^−5。建议阅读手册“6.27 ISYM-tag and SYMPREC-tag” |
2楼2012-10-09 22:18:00
horson
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谢谢！POSCAR文件修改为如下，仍然识别为C_1，不知为何？ Ca C O (Hexagonal Calcite) 1.0 4.3211203770054700 -2.4948000771893200 0.0000000000000000 0.0000000000000000 4.9896000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 0.0000000000000000 17.0610000000000000 6 6 18 Direct 0 0 0 0.666667 0.333333 0.333333 0.333333 0.666667 0.666667 0 0 0.5 0.666667 0.333333 0.833333 0.333333 0.666667 0.166667 0 0 0.25 0.666667 0.333333 0.583333 0.333333 0.666667 0.916667 0 0 0.75 0.666667 0.333333 0.083333 0.333333 0.666667 0.416667 0.2768 0 0.25 0 0.2768 0.25 0.7232 0.7232 0.25 0.666667 0.6101 0.583333 0.0565 0.3898 0.916667 0.3899 0.0565 0.583333 0.6101 0.666667 0.916667 0.9435 0.333333 0.583333 0.333333 0.9435 0.916667 0.2768 0.2768 0.75 0 0.7232 0.75 0.7232 0 0.75 0.666667 0.0565 0.083333 0.0565 0.666667 0.416667 0.3899 0.333333 0.083333 0.6101 0.9435 0.416667 0.9435 0.6101 0.083333 0.333333 0.3899 0.416667 |
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