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horson

金虫 (小有名气)

[求助] VASP识别对称性的能力如何?

据说VASP对晶体的对称性识别能力不好,并且只能粗略地识别点群而非空间群,不知是否如此?
我编辑了一个方解石的POSCAR文件,从OUTCAR文件来看VASP连点群都没有识别对。不知是不是我的理解有问题,请大伙帮我看看:

POSCAR文件(附件中有源文件):
Ca  C  O (Hexagonal Calcite)
1.0
     4.3211203770054700   -2.4948000771893200    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    4.9896000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   17.0610000000000000
   6   6  18
Direct
0           0           0
0.6667      0.3333      0.3333
0.3333      0.6667      0.6667
0           0           0.5
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0           0           0.25
0.6667      0.3333      0.5833
0.3333      0.6667      0.9167
0           0           0.75
0.6667      0.3333      0.0833
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0.2768      0           0.25
0           0.2768      0.25
0.7232      0.7232      0.25
0.6667      0.6101      0.5833
0.0565      0.3898      0.9167
0.3899      0.0565      0.5833
0.6101      0.6667      0.9167
0.9435      0.3333      0.5833
0.3333      0.9435      0.9167
0.2768      0.2768      0.75
0           0.7232      0.75
0.7232      0           0.75
0.6667      0.0565      0.0833
0.0565      0.6667      0.4167
0.3899      0.3333      0.0833
0.6101      0.9435      0.4167
0.9435      0.6101      0.0833
0.3333      0.3899      0.4167

OUTCAR的相关输出:
  LATTYP: Found a hexagonal cell.
ALAT       =     4.9895999807
C/A-ratio  =     3.4193121825

  Lattice vectors:

A1 = (   4.3211203770,  -2.4948000772,   0.0000000000)
A2 = (   0.0000000000,   4.9896000000,   0.0000000000)
A3 = (   0.0000000000,   0.0000000000,  17.0610000000)
Subroutine PRICEL returns:
Original cell was already a primitive cell.


Analysis of symmetry for initial positions (statically):

Routine SETGRP: Setting up the symmetry group for a
hexagonal supercell.


Subroutine GETGRP returns: Found  1 space group operations
(whereof  1 operations were pure point group operations)
out of a pool of 24 trial point group operations.


The static configuration has the point symmetry C_1 .

Analysis of symmetry for dynamics (positions and initial velocities):

Subroutine DYNSYM returns: Found  1 space group operations
(whereof  1 operations were pure point group operations)
out of a pool of  1 trial space group operations
(whereof  1 operations were pure point group operations)
and found also     1 'primitive' translations


The dynamic configuration has the point symmetry C_1 .
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  • 附件 1 : POSCAR
  • 2012-10-09 21:55:09, 1.14 K

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hedaors

禁虫 (正式写手)

隐清堂主


sunyang1988: 金币+1, 谢谢提示 2012-10-11 21:16:52
你修改一下 SYMPREC = 0.001 或者 0.1 试试
4楼2012-10-10 16:40:04
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查看全部 6 个回答

fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
horson: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-10-10 10:14:23
sunyang1988: 金币+1, 谢谢帮助 2012-10-11 21:17:04
"VASP includes a full featured symmetry code which determines the symmetry of arbitrary configurations automatically."
应该来说,其识别能力还是很强的。
问题在0.3333和0.6667上,至少精确到6位。如0.333333、0.666667这样才能识别出1/3和2/3。
VASP中实际上是由SYMPREC这个参数来控制的,默认值10^−5。建议阅读手册“6.27 ISYM-tag and SYMPREC-tag”
2楼2012-10-09 22:18:00
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horson

金虫 (小有名气)

送鲜花一朵
谢谢!POSCAR文件修改为如下,仍然识别为C_1,不知为何?
Ca  C  O (Hexagonal Calcite)
1.0
     4.3211203770054700   -2.4948000771893200    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    4.9896000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   17.0610000000000000
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0.7232        0.7232        0.25
0.666667      0.6101        0.583333
0.0565        0.3898        0.916667
0.3899        0.0565        0.583333
0.6101        0.666667      0.916667
0.9435        0.333333      0.583333
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0.2768        0.2768        0.75
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0.9435        0.6101        0.083333
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3楼2012-10-09 22:59:03
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horson

金虫 (小有名气)

引用回帖:
4楼: Originally posted by hedaors at 2012-10-10 16:40:04
你修改一下 SYMPREC = 0.001 或者 0.1 试试

是的,我试过SYMPREC=0.001,可以识别出D_2h,但感觉精度不够,保持对称性(ISYM=2)做结构优化后lattice parameter略微偏离了六方。
5楼2012-10-11 10:30:00
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