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horson

金虫 (小有名气)

[求助] VASP识别对称性的能力如何？

据说VASP对晶体的对称性识别能力不好，并且只能粗略地识别点群而非空间群，不知是否如此？
我编辑了一个方解石的POSCAR文件，从OUTCAR文件来看VASP连点群都没有识别对。不知是不是我的理解有问题，请大伙帮我看看：

POSCAR文件（附件中有源文件）：
Ca  C  O (Hexagonal Calcite)
1.0
     4.3211203770054700   -2.4948000771893200    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    4.9896000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   17.0610000000000000
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Direct
0           0           0
0.6667      0.3333      0.3333
0.3333      0.6667      0.6667
0           0           0.5
0.6667      0.3333      0.8333
0.3333      0.6667      0.1667
0           0           0.25
0.6667      0.3333      0.5833
0.3333      0.6667      0.9167
0           0           0.75
0.6667      0.3333      0.0833
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0.6667      0.6101      0.5833
0.0565      0.3898      0.9167
0.3899      0.0565      0.5833
0.6101      0.6667      0.9167
0.9435      0.3333      0.5833
0.3333      0.9435      0.9167
0.2768      0.2768      0.75
0           0.7232      0.75
0.7232      0           0.75
0.6667      0.0565      0.0833
0.0565      0.6667      0.4167
0.3899      0.3333      0.0833
0.6101      0.9435      0.4167
0.9435      0.6101      0.0833
0.3333      0.3899      0.4167

OUTCAR的相关输出：
  LATTYP: Found a hexagonal cell.
ALAT       =     4.9895999807
C/A-ratio  =     3.4193121825

  Lattice vectors:

A1 = (   4.3211203770,  -2.4948000772,   0.0000000000)
A2 = (   0.0000000000,   4.9896000000,   0.0000000000)
A3 = (   0.0000000000,   0.0000000000,  17.0610000000)
Subroutine PRICEL returns:
Original cell was already a primitive cell.


Analysis of symmetry for initial positions (statically):

Routine SETGRP: Setting up the symmetry group for a
hexagonal supercell.


Subroutine GETGRP returns: Found  1 space group operations
(whereof  1 operations were pure point group operations)
out of a pool of 24 trial point group operations.


The static configuration has the point symmetry C_1 .

Analysis of symmetry for dynamics (positions and initial velocities):

Subroutine DYNSYM returns: Found  1 space group operations
(whereof  1 operations were pure point group operations)
out of a pool of  1 trial space group operations
(whereof  1 operations were pure point group operations)
and found also     1 'primitive' translations


The dynamic configuration has the point symmetry C_1 .
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  • 附件 1 : POSCAR
    • 2012-10-09 21:55:09, 1.14 K

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horson

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1楼 2012-10-09 21:56:00
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fzx2008

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
horson: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-10-10 10:14:23
sunyang1988: 金币+1, 谢谢帮助 2012-10-11 21:17:04
"VASP includes a full featured symmetry code which determines the symmetry of arbitrary configurations automatically."
应该来说，其识别能力还是很强的。
问题在0.3333和0.6667上，至少精确到6位。如0.333333、0.666667这样才能识别出1/3和2/3。
VASP中实际上是由SYMPREC这个参数来控制的，默认值10^−5。建议阅读手册“6.27 ISYM-tag and SYMPREC-tag”
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2楼2012-10-09 22:18:00
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horson

金虫 (小有名气)
送鲜花一朵
谢谢！POSCAR文件修改为如下，仍然识别为C_1，不知为何？
Ca  C  O (Hexagonal Calcite)
1.0
     4.3211203770054700   -2.4948000771893200    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    4.9896000000000000    0.0000000000000000
     0.0000000000000000    0.0000000000000000   17.0610000000000000
   6   6  18
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0.333333      0.666667      0.666667
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0.0565        0.3898        0.916667
0.3899        0.0565        0.583333
0.6101        0.666667      0.916667
0.9435        0.333333      0.583333
0.333333      0.9435        0.916667
0.2768        0.2768        0.75
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0.7232        0             0.75
0.666667      0.0565        0.083333
0.0565        0.666667      0.416667
0.3899        0.333333      0.083333
0.6101        0.9435        0.416667
0.9435        0.6101        0.083333
0.333333      0.3899        0.416667
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3楼2012-10-09 22:59:03
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hedaors

禁虫 (正式写手)

隐清堂主
★
sunyang1988: 金币+1, 谢谢提示 2012-10-11 21:16:52
你修改一下 SYMPREC = 0.001 或者 0.1 试试
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4楼2012-10-10 16:40:04
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horson

金虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by hedaors at 2012-10-10 16:40:04
你修改一下 SYMPREC = 0.001 或者 0.1 试试

是的，我试过SYMPREC=0.001，可以识别出D_2h，但感觉精度不够，保持对称性（ISYM=2）做结构优化后lattice parameter略微偏离了六方。
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5楼2012-10-11 10:30:00
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踮起脚尖111

铁虫 (初入文坛)
引用回帖:
5楼: Originally posted by horson at 2012-10-11 10:30:00
是的，我试过SYMPREC=0.001，可以识别出D_2h，但感觉精度不够，保持对称性（ISYM=2）做结构优化后lattice parameter略微偏离了六方。...

问一下你的D_2h在哪里看到的？？？

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每天进步一点点
6楼2017-02-20 13:03:35
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