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用Amber制作碳纳米管的top和crd文件怎么要那么久？
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下面是我用Amber制作碳纳米管（1000个原子）的top和crd文件的步骤： 1 antechamber -i CNT.pdb -fi pdb -o CNT.mol2 -fo mol2 -c bcc -s 2 2 parmchk -i CNT.mol2 -f mol2 -o CNT.frcmod 3 $AMBERHOME/exe/xleap -f $AMBERHOME/dat/leap/cmd/leaprc.ff99SB 4 source leaprc.gaff 5 CNT=loadmol2 CNT.mol2 6 loadamberparams CNT.frcmod 7 saveoff CNT cnt.lib 8 saveamberparm CNT CNT.prmtop CNT.inpcrd 在第一步时（ antechamber -i CNT.pdb -fi pdb -o CNT.mol2 -fo mol2 -c bcc -s 2 ）怎么要那么久呢？花了5天还没完成，大家指点一下啊。 |
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