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xukm

木虫 (正式写手)

[求助] 【新人求助】构建一PVAc分子链,用discover进行minimize,怎么也不收敛

用MS构建了一90重复单元的聚醋酸乙烯酯分子链,然后用discover进行minimize,用的是smart minimize,运行150000步,力场用的是compass,然后是group based,但运行完成后报告里还是说no convergence,求高手帮忙看看是不是哪里设置有问题啊?谢谢!
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xukm

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaowu759 at 2012-10-03 18:28:32
对于长链高分子体系,不能指望很快就收敛,应反复运行多个循环,甚至结合分子动力学

请问下具体应该怎么做呢?比较小白,麻烦告知下,谢谢
5楼2012-10-06 13:16:39
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alphawei

金虫 (小有名气)

★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-03 20:00:26
您是用分子直接能量最小化?或是用AC模組?
2楼2012-10-03 17:02:15
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xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-03 20:00:39
对于长链高分子体系,不能指望很快就收敛,应反复运行多个循环,甚至结合分子动力学
3楼2012-10-03 18:28:32
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xukm

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by alphawei at 2012-10-03 17:02:15
您是用分子直接能量最小化?或是用AC模組?

我是用分子直接能量最小化的,我是想先这样最小化了之后然后再建AC模组,再次最小化
4楼2012-10-06 13:15:23
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