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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 【新人求助】构建一PVAc分子链，用discover进行minimize，怎么也不收敛
汕头大学海洋科学接受调剂
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xukm

木虫 (正式写手)

[求助] 【新人求助】构建一PVAc分子链，用discover进行minimize，怎么也不收敛

用MS构建了一90重复单元的聚醋酸乙烯酯分子链，然后用discover进行minimize，用的是smart minimize，运行150000步，力场用的是compass，然后是group based，但运行完成后报告里还是说no convergence，求高手帮忙看看是不是哪里设置有问题啊？谢谢！
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1楼 2012-10-03 12:05:00
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alphawei

金虫 (小有名气)
★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-03 20:00:26
您是用分子直接能量最小化?或是用AC模組?
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2楼2012-10-03 17:02:15
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xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-03 20:00:39
对于长链高分子体系，不能指望很快就收敛，应反复运行多个循环，甚至结合分子动力学
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3楼2012-10-03 18:28:32
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xukm

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by alphawei at 2012-10-03 17:02:15
您是用分子直接能量最小化?或是用AC模組?

我是用分子直接能量最小化的，我是想先这样最小化了之后然后再建AC模组，再次最小化
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4楼2012-10-06 13:15:23
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xukm

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaowu759 at 2012-10-03 18:28:32
对于长链高分子体系，不能指望很快就收敛，应反复运行多个循环，甚至结合分子动力学

请问下具体应该怎么做呢？比较小白，麻烦告知下，谢谢
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5楼2012-10-06 13:16:39
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liu2004m

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-10-06 20:16:31
反复运行多个循环，多试试就行
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

xukm
6楼2012-10-06 13:50:07
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xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-10-06 20:16:45
xukm: 金币+20, ★★★很有帮助 2012-10-07 14:19:29
引用回帖:
5楼: Originally posted by xukm at 2012-10-06 13:16:39
请问下具体应该怎么做呢？比较小白，麻烦告知下，谢谢...

应该很明白了吧：以一个优化后的结构为初始结构进一步优化，反复进行，或优化几个循环后的结构运行分子动力学，再运行优化，依次反复进行
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» 本帖已获得的红花（最新10朵）

xukm
7楼2012-10-06 19:03:09
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xukm

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by xiaowu759 at 2012-10-06 19:03:09
应该很明白了吧：以一个优化后的结构为初始结构进一步优化，反复进行，或优化几个循环后的结构运行分子动力学，再运行优化，依次反复进行...

好，谢谢啦
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8楼2012-10-07 14:19:15
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xukm

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by liu2004m at 2012-10-06 13:50:07
反复运行多个循环，多试试就行

恩，好的，谢谢
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9楼2012-10-07 14:20:17
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