应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 【新人求助】构建一PVAc分子链，用discover进行minimize，怎么也不收敛
91/1返回列表
查看: 1255  |  回复: 8
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

xukm

木虫 (正式写手)

[求助] 【新人求助】构建一PVAc分子链，用discover进行minimize，怎么也不收敛

用MS构建了一90重复单元的聚醋酸乙烯酯分子链，然后用discover进行minimize，用的是smart minimize，运行150000步，力场用的是compass，然后是group based，但运行完成后报告里还是说no convergence，求高手帮忙看看是不是哪里设置有问题啊？谢谢！
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
1楼 2012-10-03 12:05:00
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

alphawei

金虫 (小有名气)
★ ★
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-03 20:00:26
您是用分子直接能量最小化?或是用AC模組?
赞一下 回复此楼
2楼2012-10-03 17:02:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
jiaoyixiong: 金币+2, 鼓励交流 2012-10-03 20:00:39
对于长链高分子体系，不能指望很快就收敛，应反复运行多个循环，甚至结合分子动力学
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-03 18:28:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xukm

木虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by alphawei at 2012-10-03 17:02:15
您是用分子直接能量最小化?或是用AC模組?

我是用分子直接能量最小化的，我是想先这样最小化了之后然后再建AC模组，再次最小化
赞一下 回复此楼
4楼2012-10-06 13:15:23
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xukm

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaowu759 at 2012-10-03 18:28:32
对于长链高分子体系，不能指望很快就收敛，应反复运行多个循环，甚至结合分子动力学

请问下具体应该怎么做呢？比较小白，麻烦告知下，谢谢
赞一下 回复此楼
5楼2012-10-06 13:16:39
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

liu2004m

荣誉版主 (文坛精英)

优秀版主优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-10-06 20:16:31
反复运行多个循环，多试试就行
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

xukm
6楼2012-10-06 13:50:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xiaowu759

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2012-10-06 20:16:45
xukm: 金币+20, ★★★很有帮助 2012-10-07 14:19:29
引用回帖:
5楼: Originally posted by xukm at 2012-10-06 13:16:39
请问下具体应该怎么做呢？比较小白，麻烦告知下，谢谢...

应该很明白了吧：以一个优化后的结构为初始结构进一步优化，反复进行，或优化几个循环后的结构运行分子动力学，再运行优化，依次反复进行
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

xukm
7楼2012-10-06 19:03:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xukm

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
7楼: Originally posted by xiaowu759 at 2012-10-06 19:03:09
应该很明白了吧：以一个优化后的结构为初始结构进一步优化，反复进行，或优化几个循环后的结构运行分子动力学，再运行优化，依次反复进行...

好，谢谢啦
回复此楼
8楼2012-10-07 14:19:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xukm

木虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
6楼: Originally posted by liu2004m at 2012-10-06 13:50:07
反复运行多个循环，多试试就行

恩，好的，谢谢
回复此楼
9楼2012-10-07 14:20:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 xukm 的主题更新
91/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 今日不放榜？网传国自然预计 8 月 27 日可查结果 +17 医学老男孩 2026-08-20 22/1100 2026-08-25 15:36 by 医学老男孩
[基金申请] 放榜前的不淡定 20+4 snowwithsea 2026-08-19 18/900 2026-08-25 14:50 by Weed114114
[基金申请] 如果此刻你正在为国基感到焦虑，不妨来听听这首《基金之外》 +8 scalable 2026-08-24 8/400 2026-08-25 12:52 by jnhyjjm
[基金申请] 没有任何消息-是不是就凉了 +9 图啦图啦 2026-08-24 10/500 2026-08-25 11:59 by 南海小哥
[基金申请] 人气不行了 +11 fansofjerry 2026-08-21 11/550 2026-08-25 11:04 by 孤独的英雄6
[基金申请] 2026国自然函评费到账 +19 羊腰板 2026-08-21 22/1100 2026-08-25 10:38 by popular289
[教师之家] 导师吐槽：我怎么摊上了这么个极品研究生！ +3 苏东坡二世 2026-08-23 3/150 2026-08-25 10:35 by shisan1313
[基金申请] 2026年的国家社科基金项目通讯评审的新规则与新动向、新挑战 +5 process2012 2026-08-23 7/350 2026-08-25 09:42 by huixian257
[基金申请] 范进中举一文的中心思想 +7 炎黄贵胄 2026-08-22 8/400 2026-08-25 08:48 by ZJTJZ
[基金申请] 只有每年这种时候来逛逛小木虫 +25 yaoyewhu2008 2026-08-20 27/1350 2026-08-25 08:01 by Equinoxhua
[基金申请] filecode，4个jtjc了 +14 ziyangfang 2026-08-19 17/850 2026-08-24 18:37 by 哈哈蛤？
[基金申请] 建议基金发布提前给出明确的时间点 +13 kulium 2026-08-21 16/800 2026-08-24 16:27 by superceng
[基金申请] 让我中一个面上吧！ +13 大萍1987 2026-08-20 16/800 2026-08-24 10:23 by 太傻了
[教师之家] 跳槽后在研项目怎么办？ +5 简单化xn 2026-08-22 10/500 2026-08-23 12:38 by 简单化xn
[基金申请] 今天放榜吗？ +15 布布和一二 2026-08-19 16/800 2026-08-23 09:55 by 张春生
[基金申请] 时间戳今天，20号变了 +5 archvillain 2026-08-20 5/250 2026-08-22 06:12 by hui_daxiao
[基金申请] 看来今天不会放榜了？ +8 chengyan1220 2026-08-21 11/550 2026-08-21 17:52 by dcqxinyang
[基金申请] 时间戳又变了 +13 wuchongjun 2026-08-20 19/950 2026-08-21 17:21 by 紫杉醇
[基金申请] 应该是下周三26日公布了吧？ +4 哈哈蛤？ 2026-08-21 4/200 2026-08-21 10:58 by Vivilian
[基金申请] 基金啊基金 +4 longfie172 2026-08-20 4/200 2026-08-21 08:58 by mark mao
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭