应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 进化树
52/1返回列表
查看: 1242  |  回复: 11
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

mahoumeimei

金虫 (小有名气)

[求助] 进化树

要画进化树，有两个问题请教：
1.在NCBI上下载了一些序列，请问如何快速判断这些序列的正反向？
2.用Clustal X比对后，不同长度的序列需要进行裁剪吗？如果需要，应该怎么操作？
回复此楼

» 猜你喜欢
1楼 2012-10-02 13:34:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yuzhongjian

铁虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mahoumeimei: 金币+1, 谢谢 2012-10-04 12:05:53
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-10-28 17:37:12
方向都是确定的从5--3，关于序列的裁剪，这个好像你应该选类型的序列，比如都是16S,都是18S的，估计NCBI上比对出来就是同一类型的！
赞一下 回复此楼
11楼2012-10-04 11:50:49
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

chenguestc

木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
mahoumeimei: 金币+5, ★★★很有帮助 2012-10-02 17:01:01
小丹木木: 金币+1, 鼓励交流 2012-10-02 21:38:43
1,把所有序列设成同一方向即可。
2，需要删除多余部分。把多余部分在MEGA中选中，DELET即可。
赞一下 回复此楼
2楼2012-10-02 14:30:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

mahoumeimei

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chenguestc at 2012-10-02 14:30:15
1,把所有序列设成同一方向即可。
2，需要删除多余部分。把多余部分在MEGA中选中，DELET即可。

非常感谢！可是“把所有序列设成同一方向”是什么意思？
赞一下 回复此楼
3楼2012-10-02 17:01:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

qiuqu_200212

至尊木虫 (知名作家)

无助又无奈

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
mahoumeimei: 金币+1 2012-10-03 10:23:10
如果长短差异太大，建议剪切一下，然后用不同的软件采用不同的方法构建。
赞一下 回复此楼
无奈又无助的天鹅，孤零零
4楼2012-10-02 20:05:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭