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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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zhouzhiguang

金虫 (小有名气)

[求助] QM/MM优化后的模型跑MD,可行性如何?

我用DS的minizaition(QM-MM)做了个优化的模型,想要跑一下MD。大家认为这样做有可行性吗?
谢谢
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lujunyan1118

金虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs: 金币+2, 谢谢 2012-10-09 22:44:15
zhouzhiguang: 金币+3, ★★★很有帮助 2012-10-09 23:06:31
可以是可以,但是感觉意义不太大

虽然QM/MM可以得到稍微更合理一点的初始结构,再用MD模拟所采用的电荷等参数还是来自于分子立场,也就是并不会像QM/MM中高层的区那样电荷会随结构变化而变化。所以,我觉得结果应该差不多。

如果对初始结构要求很高的话,可以试试
2楼2012-10-09 21:49:07
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