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fanhongxiang

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助:Castep优化乙苯在表面的吸附,乙苯变得很扭曲

用Castep优化乙苯在Fe表面的吸附时,乙苯苯环变得很扭曲,几乎不在同一个表面,怎么办,求高手相助

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fanhongxiang

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by cosfrist at 2012-09-24 14:10:34
你要弛豫Z方向啊,怎么会优化之后不变呢?而且吸附表面(下面的表面)需要弛豫,不能固定,只是限制苯环的X,Y平面的变形而已。

晚辈愚钝,有些地方还是不太明白:
(1)就像您在起初回复时说的,苯环的扭曲是由于“吸附表面对苯环的不同原子的吸附作用不一样造成的”如果把x,y方向固定后,表面对苯环不同原子的吸附作用如何体现?
(2)您说的“吸附表满(下面的表面)需要弛豫,不能固定”是不是意味着:在计算吸附能时,是一个结构(吸附表面不固定);而在搜索过度态时(由于吸附表面需要固定),该结构就不能用了,而需要再优化一遍
谢谢赐教,不胜感激啊
BestWishes
8楼2012-09-24 15:26:15
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cosfrist

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
franch: 金币+1, 谢谢回帖交流 2012-09-24 15:31:57
fanhongxiang: 金币+15, 有帮助 2012-09-29 09:03:45
可以限制X,Y方向,弛豫Z方向~
力学出身搞过生物医学工程的研究计算材料学的医学影像系青椒一枚
2楼2012-09-23 20:22:15
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fanhongxiang

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by cosfrist at 2012-09-23 20:22:15
可以限制X,Y方向,弛豫Z方向~

~~~是Fix Cartesian position 中么?那苯环变得这么扭曲是什么原因造成的啊?
BestWishes
3楼2012-09-23 20:27:08
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cosfrist

木虫 (小有名气)

★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-09-24 15:32:10
吸附限制X,Y方向就可以避免苯环内原子的相对变形,会整体向吸附面靠近。你不做限制的话,就可以造成扭曲,原因当然是吸附表面对苯环的不同原子的吸附作用不一样造成的啦
力学出身搞过生物医学工程的研究计算材料学的医学影像系青椒一枚
4楼2012-09-24 09:41:46
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