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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » MS » 求助：Castep优化乙苯在表面的吸附，乙苯变得很扭曲
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fanhongxiang

铁虫 (小有名气)

[求助] 求助：Castep优化乙苯在表面的吸附，乙苯变得很扭曲

用Castep优化乙苯在Fe表面的吸附时，乙苯苯环变得很扭曲，几乎不在同一个表面，怎么办，求高手相助

未命名.jpg
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BestWishes
1楼 2012-09-23 20:21:05
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cosfrist

木虫 (小有名气)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流 2012-09-24 15:32:10
吸附限制X,Y方向就可以避免苯环内原子的相对变形，会整体向吸附面靠近。你不做限制的话，就可以造成扭曲，原因当然是吸附表面对苯环的不同原子的吸附作用不一样造成的啦
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力学出身搞过生物医学工程的研究计算材料学的医学影像系青椒一枚
4楼2012-09-24 09:41:46
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cosfrist

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
franch: 金币+1, 谢谢回帖交流 2012-09-24 15:31:57
fanhongxiang: 金币+15, ★有帮助 2012-09-29 09:03:45
可以限制X,Y方向，弛豫Z方向~
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力学出身搞过生物医学工程的研究计算材料学的医学影像系青椒一枚
2楼2012-09-23 20:22:15
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fanhongxiang

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by cosfrist at 2012-09-23 20:22:15
可以限制X,Y方向，弛豫Z方向~

~~~是Fix Cartesian position 中么？那苯环变得这么扭曲是什么原因造成的啊？
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BestWishes
3楼2012-09-23 20:27:08
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fanhongxiang

铁虫 (小有名气)
引用回帖:
4楼: Originally posted by cosfrist at 2012-09-24 09:41:46
吸附限制X,Y方向就可以避免苯环内原子的相对变形，会整体向吸附面靠近。你不做限制的话，就可以造成扭曲，原因当然是吸附表面对苯环的不同原子的吸附作用不一样造成的啦

谢谢你细心的解答，不过我还想问一下，Castep里只有 Cartesian才可以限制X,Y 方向，而限制 Cartesian就意味着吸附质的笛卡尔坐标不变，这样如果吸附质原来在5A的位置的话，优化完之后，还在5A，这样算出来的结果正确么？
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BestWishes
5楼2012-09-24 10:29:38
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