应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gaussian » 做scan时怎么保持两个原子间键长不变
51/1返回列表
查看: 1784  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

银色蒲公英

银虫 (小有名气)

[求助] 做scan时怎么保持两个原子间键长不变

例如扫描分子A-B-C-D中的BC键长，怎么保持CD键长不变?
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

过渡态计算 Gaussian

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
只要你勇敢地说再见，生活一定赐予你一个新的开始
1楼 2012-09-20 09:23:46
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuanan027

木虫 (著名写手)
你是要柔性扫描还是刚性扫描。前者是每发生一次变化（如例子中每增加0.1埃）都要优化结构到合理的状态（除了你规定不变的键长外）；刚性扫描的话只是计算设定单点的能量，不会进行结构优化。如果你用前者，就像我之前给你写的那样写就好了(把A B 改成B C，之前这里写错了)。如果用后者，又没有你想固定的那两个原子之间的键长的话，只能一步步自己调bc距离算单点了。不知道我说的对不对，还望看到这个帖子的大虾斧正。
赞一下 回复此楼
Timeandtidewaitfornoman.Comeon,baby!
6楼2012-09-20 17:11:47
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

chuanan027

木虫 (著名写手)
opt=modredundant，你查一下这个关键词的用法就知道了。
赞一下 回复此楼
Timeandtidewaitfornoman.Comeon,baby!
2楼2012-09-20 12:52:43
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

银色蒲公英

银虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by chuanan027 at 2012-09-20 12:52:43
opt=modredundant，你查一下这个关键词的用法就知道了。

谢谢！我看到这样一个例子：
# HF/6-31G* Opt=ModRedundant Test
Partial optimization
1 1
C  
H 1 R1
H 1 R1 2 A1
O 1 R2 2 A2 3 120.0
H 4 R3 3 A3 2 180.0
A1=120.0
...
R3=1.1

4 5        1.3 F
5 4 3 2        F

这个例子中1.3F和F代表什么？
赞一下 回复此楼
只要你勇敢地说再见，生活一定赐予你一个新的开始
3楼2012-09-20 14:45:19
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chuanan027

木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by 银色蒲公英 at 2012-09-20 14:45:19
谢谢！我看到这样一个例子：
# HF/6-31G* Opt=ModRedundant Test
Partial optimization
1 1
C  
H 1 R1
H 1 R1 2 A1
O 1 R2 2 A2 3 120.0
H 4 R3 3 A3 2 180.0
A1=120.0
...
R3=1.1

4 5  ...

4 5 1.3 F
表示将4和5这两个原子的距离固定在1.3埃.
如果写成
4 5 s 20 0.1
表示柔性扫描4跟5之间距离，扫描步数为20步，每步步长为0.1埃，s表扫描。
按照你的想法这样写好了
前面用opt=modredundant，分子构型后面写
C D F
A B S 20 0.1
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

银色蒲公英
Timeandtidewaitfornoman.Comeon,baby!
4楼2012-09-20 15:33:53
已阅   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 申请科研项目纯靠实力能成功吗？ 200+5 David1982 2026-10-13 8/400 2026-10-14 21:38 by lhw_GPA4.0
[职场人生] 40+中年人失业后，还能找到好工作吗？ +3 xqy2009 2026-10-13 3/150 2026-10-14 20:17 by 43358052
[论文投稿] 二审4个多月了还是Awaiting Reviewer Scores 10+3 纳斯达克ML 2026-10-11 4/200 2026-10-14 17:30 by babero
[有机交流] OpenAI又攻克数学难题了，离AI做有机合成还有多远？ +8 wangyl_123 2026-10-10 13/650 2026-10-14 15:12 by zuesli
[硕博家园] 极限拉扯，如何抉择 +10 Isak0320 2026-10-12 14/700 2026-10-14 11:39 by thegarfield
[教师之家] 课题组会帮你通过考核么？ +4 好运来～9527 2026-10-10 7/350 2026-10-13 08:41 by xli1984
[基金申请] 入职后第一次管课题组的专利缴费，对账才发现官费比别人多掏了一倍 +6 13108017953 2026-10-08 6/300 2026-10-12 20:07 by w3w3y3
[公派出国] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:34 by XQNyDCa1Tk5n
[考博] 售SCI一区T0P文章，我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 9/450 2026-10-11 22:15 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI文章，我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 22:06 by XQNyDCa1Tk5n
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 (EPI+-1)(金币-50) +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 10/500 2026-10-11 14:25 by VOMexwnDzOFZ
[教师之家] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 (EPI+-1)(金币-50) +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 14:05 by VOMexwnDzOFZ
[考研] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:51 by VOMexwnDzOFZ
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +5 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 8/400 2026-10-11 13:45 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:54 by VOMexwnDzOFZ
[找工作] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 7/350 2026-10-11 10:34 by VOMexwnDzOFZ
[考博] 招收博士生一名 +3 mandolin 2026-10-10 3/150 2026-10-11 10:21 by 不是山谷！
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +4 qR2AdCWTVtkw 2026-10-09 4/200 2026-10-11 03:14 by M0zrYVSAnxpE
[有机交流] 各位大佬，路线设计求助 +6 zapen 2026-10-08 8/400 2026-10-10 15:59 by zapen
[有机交流] 我应该选哪条合成路线让实验成功率高一些？ +5 jing816y 2026-10-08 9/450 2026-10-10 09:05 by zapen
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭